30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_05411 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_05411  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 238 aa  466  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0882215  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0478  short chain dehydrogenase  77.92 
 
 		 239 aa  338  5e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05031  short chain dehydrogenase  78.51 
 
 		 239 aa  336  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05331  short chain dehydrogenase  77.63 
 
 		 239 aa  331  6e-90  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.647746  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06851  short chain dehydrogenase  47.58 
 
 		 256 aa  227  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1713  short chain dehydrogenase  44.98 
 
 		 249 aa  218  5e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04781  short chain dehydrogenase  49.34 
 
 		 257 aa  217  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.864402 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0646  short chain dehydrogenase  45.41 
 
 		 245 aa  196  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05341  short chain dehydrogenase  44.74 
 
 		 254 aa  190  2e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.118311 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1810  short chain dehydrogenase  45.18 
 
 		 254 aa  187  1e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0109813  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3384  bifunctional sterol desaturase/short chain dehydrogenase  43.91 
 
 		 404 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0842787 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3742  bifunctional sterol desaturase/short chain dehydrogenase  41.85 
 
 		 420 aa  174  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.843241  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0613  bifunctional sterol desaturase/short chain dehydrogenase  42.17 
 
 		 407 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0598  bifunctional sterol desaturase/short chain dehydrogenase  42.17 
 
 		 407 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0861  bifunctional sterol desaturase/short chain dehydrogenase  38.16 
 
 		 429 aa  171  6.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0589823  normal  0.0593314 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1743  bifunctional sterol desaturase/short chain dehydrogenase  40 
 
 		 409 aa  167  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.505987  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4290  fatty acid hydroxylase  41.26 
 
 		 412 aa  161  7e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.762452  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.81 
 
 		 257 aa  48.1  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.422547  normal  0.568742 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3062  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.86 
 
 		 245 aa  48.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.108862  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50236  predicted protein  31.71 
 
 		 267 aa  48.1  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.370457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 		 256 aa  46.2  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_12277  hypothetical protein  24.24 
 
 		 423 aa  46.2  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0609  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000037264  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3913  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  20.86 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4327  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.03 
 
 		 295 aa  43.5  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581681  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.55 
 
 		 236 aa  43.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.235673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1645  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.43 
 
 		 233 aa  42.7  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.138611  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7047  domain of unknown function DUF1731  27.94 
 
 		 309 aa  42.7  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1751  hypothetical protein  25 
 
 		 311 aa  42.4  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.888541  normal  0.757585 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.08 
 
 		 264 aa  42.4  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.132419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>