19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_06111 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_06111  ribonuclease P protein component  100 
 
 
128 aa  258  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.216071 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0579  ribonuclease P protein component of ribozyme  57.94 
 
 
128 aa  134  3.0000000000000003e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16581  ribonuclease P protein component  46.03 
 
 
128 aa  111  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12711  ribonuclease P protein component  43.51 
 
 
130 aa  110  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373516 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1785  ribonuclease P protein component of ribozyme  59.52 
 
 
128 aa  110  9e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.391704  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0803  ribonuclease P protein component  47.66 
 
 
128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.530045  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13561  ribonuclease P protein component  35.66 
 
 
129 aa  94  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.269036  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13771  ribonuclease P protein component  34.65 
 
 
128 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.805452  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13851  ribonuclease P protein component  35.43 
 
 
128 aa  82  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.91647  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1285  ribonuclease P protein component  35.94 
 
 
128 aa  82  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.240066  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0896  ribonuclease P  28.68 
 
 
129 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4708  ribonuclease P  30.23 
 
 
159 aa  53.9  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0685  ribonuclease P protein component  28.87 
 
 
140 aa  53.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4062  ribonuclease P  31.25 
 
 
127 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4101  ribonuclease P  27.56 
 
 
127 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  39.19 
 
 
131 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3433  ribonuclease P  28.78 
 
 
140 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27050  predicted protein  23.3 
 
 
164 aa  41.6  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.121605  hitchhiker  0.000860128 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1200  ribonuclease P protein component  29.17 
 
 
150 aa  40.8  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00390619 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>