56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_14681 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_14681  integral membrane protein, interacts with FtsH  100 
 
 
245 aa  466  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.243833  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14821  integral membrane protein, interacts with FtsH  100 
 
 
245 aa  466  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.90511  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1379  integral membrane protein, interacts with FtsH  99.18 
 
 
245 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14441  integral membrane protein, interacts with FtsH  94.29 
 
 
245 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.467413  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13301  integral membrane protein, interacts with FtsH  84.9 
 
 
245 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.796409  normal  0.703525 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0850  integral membrane protein, interacts with FtsH  79.18 
 
 
245 aa  325  3e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17031  integral membrane protein, interacts with FtsH  79.18 
 
 
245 aa  325  3e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1514  hypothetical protein  74.29 
 
 
243 aa  323  2e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19531  integral membrane protein, interacts with FtsH  70.73 
 
 
246 aa  319  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.688196 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0885  hypothetical protein  72.24 
 
 
243 aa  295  5e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1820  hypothetical protein  58.44 
 
 
242 aa  257  1e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.53657  normal  0.302563 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2121  hypothetical protein  51.02 
 
 
244 aa  224  1e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.899925  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0690  integral membrane protein interacts with FtsH  49.39 
 
 
242 aa  221  8e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000220469  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0671  hypothetical protein  49.39 
 
 
242 aa  221  9e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2056  hypothetical protein  49.8 
 
 
242 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.703737 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0296  integral membrane protein, interacts with FtsH  31.16 
 
 
229 aa  58.2  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1604  hypothetical protein  31.79 
 
 
229 aa  57.4  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000120987  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2972  hypothetical protein  26.61 
 
 
237 aa  54.7  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416031  normal  0.346292 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1899  integral membrane protein, interacts with FtsH  30.81 
 
 
237 aa  53.9  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0383513  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2779  hypothetical protein  26.7 
 
 
240 aa  53.1  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.196634  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0424  protein of unknown function UPF0005  25.43 
 
 
217 aa  51.6  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0001  hypothetical protein  26.02 
 
 
257 aa  50.8  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4482  protein of unknown function UPF0005  27.65 
 
 
236 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2135  protein of unknown function UPF0005  29.03 
 
 
224 aa  47.8  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000126881  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6925  hypothetical protein  23.46 
 
 
239 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0088  hypothetical protein  24.3 
 
 
245 aa  46.2  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0795  hypothetical protein  27.17 
 
 
236 aa  45.8  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1390  hypothetical protein  26.84 
 
 
256 aa  45.4  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.330784 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2601  membrane protein, putaive  25.5 
 
 
233 aa  45.4  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232013  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04050  vacuole protein, putative  31.11 
 
 
283 aa  45.4  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.701829  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0086  hypothetical protein  24.3 
 
 
245 aa  45.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0912  hypothetical protein  26.14 
 
 
232 aa  44.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.409421  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0538  hypothetical protein  29.96 
 
 
228 aa  45.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0549  hypothetical protein  29.94 
 
 
232 aa  44.3  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.235256  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1173  protein of unknown function UPF0005  26.94 
 
 
240 aa  43.9  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00047203  normal  0.359337 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4057  protein of unknown function UPF0005  26.8 
 
 
242 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4550  hypothetical protein  24.7 
 
 
236 aa  43.9  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00145642 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2427  protein of unknown function UPF0005  29.53 
 
 
236 aa  43.9  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84906  predicted protein  28.03 
 
 
252 aa  43.9  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.521244  normal  0.814262 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1438  hypothetical protein  28 
 
 
236 aa  43.5  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3076  hypothetical protein  26.17 
 
 
245 aa  43.9  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0738  protein of unknown function UPF0005  27.7 
 
 
234 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000107382  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1143  hypothetical protein  28.14 
 
 
247 aa  43.5  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6220  hypothetical protein  24.37 
 
 
238 aa  43.5  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107819  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4182  hypothetical protein  26.55 
 
 
256 aa  43.9  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.253743  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1019  hypothetical protein  26.26 
 
 
256 aa  43.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.219255  normal  0.241296 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2081  protein of unknown function UPF0005  28.23 
 
 
224 aa  42.7  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0430200000000002e-29 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1325  hypothetical protein  29.84 
 
 
236 aa  42.7  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.891235  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0100  hypothetical protein  24.54 
 
 
260 aa  42.4  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.179512  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0536  hypothetical protein  26.63 
 
 
246 aa  42.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1889  hypothetical protein  26.63 
 
 
246 aa  42.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0443  hypothetical protein  25.98 
 
 
256 aa  42.4  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1395  hypothetical protein  26.94 
 
 
252 aa  42.4  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.681625  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3734  protein of unknown function UPF0005  27.51 
 
 
242 aa  42  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01133  Putative uncharacterized protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O74710]  32 
 
 
270 aa  41.6  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.234786  normal  0.0831451 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2134  protein of unknown function UPF0005  25.93 
 
 
235 aa  42  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000183428  normal  0.170874 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>