50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_15971 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_15971  ferredoxin  100 
 
 
128 aa  269  8.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04481  3Fe-4S ferredoxin  62.6 
 
 
126 aa  161  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1007  ferredoxin  60.53 
 
 
139 aa  152  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18761  hypothetical protein  60.53 
 
 
139 aa  153  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16571  hypothetical protein  55.28 
 
 
121 aa  143  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.262713  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16791  hypothetical protein  57.41 
 
 
119 aa  140  5e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16671  hypothetical protein  56.48 
 
 
119 aa  138  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1570  hypothetical protein  54.55 
 
 
119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1749  ferredoxin  59.6 
 
 
130 aa  127  5.0000000000000004e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.855381 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0615  3Fe-4S ferredoxin  69.14 
 
 
92 aa  123  1e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1897  ferredoxin  52.21 
 
 
137 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1921  Ferredoxin-like protein  50.44 
 
 
137 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.207385  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2578  hypothetical protein  67.9 
 
 
108 aa  118  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.390984  normal  0.110309 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2057  3Fe-4S ferredoxin  63.86 
 
 
87 aa  118  3e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0381286  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2579  ferredoxin  61.18 
 
 
151 aa  118  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.698297  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2647  ferredoxin  65.85 
 
 
152 aa  118  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.668061  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0839  Ferredoxin-like protein  53.47 
 
 
156 aa  117  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00930022 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0107  ferredoxin  63.41 
 
 
151 aa  116  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.8941  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5089  ferredoxin  52.63 
 
 
171 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.536243  normal  0.0695219 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_7660  predicted protein  55.56 
 
 
88 aa  90.1  9e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_9697  predicted protein  60.61 
 
 
73 aa  83.6  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.012492  normal  0.333418 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7956  predicted protein  53.73 
 
 
167 aa  74.7  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00346454  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3088  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  50 
 
 
62 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1186  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  50 
 
 
62 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.627413  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45684  predicted protein  40.23 
 
 
561 aa  60.5  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0154  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.38 
 
 
63 aa  58.2  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.286313 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1625  ferredoxin family protein, putative  37.29 
 
 
65 aa  55.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.216587  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1206  hypothetical protein  43.33 
 
 
317 aa  54.3  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1365  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  46.55 
 
 
63 aa  53.9  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2933  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.67 
 
 
64 aa  52.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0148  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  43.1 
 
 
62 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0429  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.27 
 
 
64 aa  51.6  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00643202  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0467  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.9 
 
 
64 aa  51.2  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.915764  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3449  ferredoxin family protein, putative  38.33 
 
 
62 aa  50.8  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2919  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  43.1 
 
 
63 aa  50.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.74825 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3170  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  42.11 
 
 
63 aa  50.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000199396  normal  0.668845 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0773  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.09 
 
 
59 aa  50.4  0.000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.27215  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3187  ferredoxin family protein  41.07 
 
 
63 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3697  ferredoxin family protein, putative  42.62 
 
 
64 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0198  ferredoxin family protein, putative  40.98 
 
 
64 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0848  ferredoxin family protein, putative  38.36 
 
 
73 aa  47.8  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3492  ferredoxin family protein, putative  40.98 
 
 
73 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3169  ferredoxin family protein, putative  38.33 
 
 
64 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1093  ferredoxin family protein, putative  38.33 
 
 
64 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3343  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.07 
 
 
63 aa  45.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000237293  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0900  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.5 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.800089  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2497  hypothetical protein  36.67 
 
 
66 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000099072  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2676  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.67 
 
 
64 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1814  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.67 
 
 
64 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0286  ferredoxin II  35.48 
 
 
64 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00127142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>