27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_04781 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_04781  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 257 aa  520  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.864402 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06851  short chain dehydrogenase  61.54 
 
 		 256 aa  296  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1713  short chain dehydrogenase  57.02 
 
 		 249 aa  275  7e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0646  short chain dehydrogenase  54.27 
 
 		 245 aa  244  8e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1810  short chain dehydrogenase  51.98 
 
 		 254 aa  239  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0109813  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05341  short chain dehydrogenase  51.1 
 
 		 254 aa  238  9e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.118311 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05031  short chain dehydrogenase  53.02 
 
 		 239 aa  221  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05331  short chain dehydrogenase  53.78 
 
 		 239 aa  221  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.647746  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0478  short chain dehydrogenase  51.72 
 
 		 239 aa  212  5.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05411  short chain dehydrogenase  49.34 
 
 		 238 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0882215  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3384  bifunctional sterol desaturase/short chain dehydrogenase  45.53 
 
 		 404 aa  198  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0842787 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1743  bifunctional sterol desaturase/short chain dehydrogenase  45.3 
 
 		 409 aa  196  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.505987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0598  bifunctional sterol desaturase/short chain dehydrogenase  43.29 
 
 		 407 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0613  bifunctional sterol desaturase/short chain dehydrogenase  43.29 
 
 		 407 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0861  bifunctional sterol desaturase/short chain dehydrogenase  41.03 
 
 		 429 aa  178  8e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0589823  normal  0.0593314 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3742  bifunctional sterol desaturase/short chain dehydrogenase  40.93 
 
 		 420 aa  162  6e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.843241  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4290  fatty acid hydroxylase  39.3 
 
 		 412 aa  149  6e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.762452  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_12277  hypothetical protein  24.12 
 
 		 423 aa  48.9  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.03 
 
 		 233 aa  46.2  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4625  short chain dehydrogenase  26.87 
 
 		 249 aa  45.8  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402352  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0403  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.53 
 
 		 237 aa  45.4  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.140375  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6846  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.27 
 
 		 289 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0461  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.26 
 
 		 284 aa  43.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0561993 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.55 
 
 		 260 aa  42.7  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.22175 
 
 
-
 
NC_002978  WD1293  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  26.79 
 
 		 243 aa  43.1  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.991698  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5146  short chain dehydrogenase  25.85 
 
 		 249 aa  42.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.485132 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3786  putative Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.37 
 
 		 247 aa  42.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>