16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2946 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2946  hypothetical protein  100 
 
 		 570 aa  1173    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2277  hypothetical protein  30.65 
 
 		 536 aa  114  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3164  hypothetical protein  28.39 
 
 		 534 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.62222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2142  hypothetical protein  26.1 
 
 		 528 aa  97.8  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.222842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1998  hypothetical protein  25.56 
 
 		 528 aa  87  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4665  hypothetical protein  25.7 
 
 		 506 aa  84.7  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.708164 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0433  hypothetical protein  27.02 
 
 		 569 aa  82.4  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4748  hypothetical protein  25.49 
 
 		 506 aa  80.9  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.285287 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2776  Fibronectin type III domain protein  25.32 
 
 		 823 aa  70.1  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000481721  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0833  hypothetical protein  23.53 
 
 		 545 aa  67.8  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.488386  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2986  hypothetical protein  22.76 
 
 		 1042 aa  62.4  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.587543  hitchhiker  0.000328281 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45737  predicted protein  23.96 
 
 		 882 aa  51.6  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.194505  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1839  signal peptide and transmembrane prediction  24.46 
 
 		 648 aa  49.3  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2739  hypothetical protein  26.67 
 
 		 543 aa  49.3  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.731986  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3064  hypothetical protein  24.66 
 
 		 493 aa  48.5  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00098434 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3897  hypothetical protein  27.43 
 
 		 859 aa  44.3  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00760567  normal  0.272372 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>