More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1965 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  43.52 
 
 
3470 aa  801    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0363  amino acid adenylation domain-containing protein  40.2 
 
 
2125 aa  645    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.831612 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1972  amino acid adenylation domain-containing protein  42.25 
 
 
3018 aa  653    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.812164 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  39.84 
 
 
4317 aa  694    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  46.47 
 
 
5953 aa  861    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  45.39 
 
 
6889 aa  884    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  39.81 
 
 
3942 aa  666    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  41.87 
 
 
4336 aa  785    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01401  enterobactin synthase subunit F  37.21 
 
 
1317 aa  642    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  42.12 
 
 
6006 aa  687    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  42.51 
 
 
2151 aa  842    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  39.93 
 
 
2875 aa  710    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3542  amino acid adenylation domain-containing protein  44.82 
 
 
2845 aa  801    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  40.47 
 
 
1753 aa  783    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  40.89 
 
 
3432 aa  798    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  41.89 
 
 
4531 aa  795    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  36.65 
 
 
2156 aa  733    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4084  amino acid adenylation domain-containing protein  40.2 
 
 
1114 aa  713    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85613  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  41.7 
 
 
4317 aa  739    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1874  amino acid adenylation domain-containing protein  37.49 
 
 
1553 aa  643    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1646  putative peptide synthetase  42.29 
 
 
1483 aa  690    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  41.91 
 
 
4968 aa  827    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0024  linear gramicidin synthetase subunit D  30.51 
 
 
3374 aa  700    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1793  amino acid adenylation  39.65 
 
 
1370 aa  677    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0250793 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  41.85 
 
 
4336 aa  786    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  42.63 
 
 
1789 aa  742    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  43.45 
 
 
2154 aa  825    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1960  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  41.19 
 
 
2883 aa  693    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.77716 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  36.61 
 
 
2156 aa  721    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  39.71 
 
 
9498 aa  649    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  42.15 
 
 
6661 aa  740    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  37.04 
 
 
13537 aa  642    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  43.19 
 
 
6676 aa  801    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  32.87 
 
 
2138 aa  641    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  40.8 
 
 
2370 aa  695    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  38.42 
 
 
2867 aa  687    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  44 
 
 
2791 aa  977    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  38.42 
 
 
1142 aa  699    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  47.15 
 
 
3308 aa  956    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  40.28 
 
 
3498 aa  755    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3855  amino acid adenylation  50.08 
 
 
888 aa  663    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2858  peptide synthase  45.28 
 
 
4136 aa  812    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  40.11 
 
 
2033 aa  741    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1859  amino acid adenylation domain-containing protein  41.07 
 
 
2596 aa  679    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4109  amino acid adenylation  36.6 
 
 
1786 aa  647    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.208816  normal  0.227369 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1970  amino acid adenylation domain-containing protein  42.21 
 
 
1137 aa  680    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0949143 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4837  amino acid adenylation  37.51 
 
 
1093 aa  654    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0536139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  40.75 
 
 
4317 aa  721    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  40.19 
 
 
4991 aa  716    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  42.86 
 
 
3348 aa  826    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  44.41 
 
 
3432 aa  805    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  37.66 
 
 
6072 aa  657    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  37.94 
 
 
4572 aa  645    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  42.95 
 
 
3291 aa  822    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  40.67 
 
 
5654 aa  681    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  41.41 
 
 
4502 aa  832    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3546  amino acid adenylation domain-containing protein  47.16 
 
 
3404 aa  846    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  40.69 
 
 
5422 aa  678    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  45.48 
 
 
4882 aa  811    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  38.45 
 
 
3002 aa  653    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2266  amino acid adenylation  41.23 
 
 
1369 aa  707    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654953  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  43.96 
 
 
4332 aa  770    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  35.2 
 
 
3291 aa  718    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  40.61 
 
 
3639 aa  683    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  40.75 
 
 
4960 aa  814    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1830  amino acid adenylation  38.48 
 
 
1138 aa  637    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3541  amino acid adenylation domain-containing protein  38.52 
 
 
2137 aa  638    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.432696  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  46.35 
 
 
8646 aa  862    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2413  amino acid adenylation domain-containing protein  37.47 
 
 
1569 aa  638    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  44.4 
 
 
5328 aa  825    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2415  amino acid adenylation domain-containing protein  38.33 
 
 
1127 aa  682    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1965  amino acid adenylation domain-containing protein  100 
 
 
2439 aa  4816    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.229236 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  43.16 
 
 
4489 aa  727    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  31.35 
 
 
3111 aa  858    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  45.53 
 
 
5596 aa  867    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0362  amino acid adenylation domain-containing protein  44.58 
 
 
2350 aa  747    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.197157 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  39.97 
 
 
4317 aa  698    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  43.55 
 
 
4383 aa  681    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2968  amino acid adenylation domain-containing protein  36.31 
 
 
1331 aa  704    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  44.42 
 
 
3176 aa  848    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  43.49 
 
 
4478 aa  777    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  42.34 
 
 
4342 aa  735    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  45.1 
 
 
5149 aa  817    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  40.38 
 
 
2189 aa  671    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  39.05 
 
 
2448 aa  662    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  42.23 
 
 
4342 aa  730    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0618  putative peptide synthetase  42.29 
 
 
1483 aa  690    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.099304  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3972  amino acid adenylation domain-containing protein  41.32 
 
 
1126 aa  662    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.47287  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  40.51 
 
 
1816 aa  735    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  38.38 
 
 
6081 aa  662    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3731  amino acid adenylation domain-containing protein  42.77 
 
 
1130 aa  701    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201667  normal  0.167868 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  40.25 
 
 
1779 aa  647    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4085  amino acid adenylation domain-containing protein  40.54 
 
 
2606 aa  701    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1733  putative peptide synthetase  42.29 
 
 
1528 aa  690    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1675  amino acid adenylation domain-containing protein  41.39 
 
 
1129 aa  679    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1088  hypothetical protein  40.15 
 
 
2187 aa  671    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1938  putative peptide synthetase  42.29 
 
 
1520 aa  690    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0845  amino acid adenylation domain-containing protein  37.47 
 
 
1119 aa  663    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0731661  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4086  amino acid adenylation domain-containing protein  38.14 
 
 
2155 aa  655    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  35.91 
 
 
3101 aa  729    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.195315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>