22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1131 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1131  hypothetical protein  100 
 
 		 74 aa  154  6e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637215  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2958  hypothetical protein  40.28 
 
 		 72 aa  61.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1055  hypothetical protein  36.11 
 
 		 72 aa  61.2  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.231807  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1984  hypothetical protein  40.58 
 
 		 78 aa  57.4  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1749  hypothetical protein  37.68 
 
 		 77 aa  56.2  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1737  hypothetical protein  33.33 
 
 		 73 aa  53.5  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2086  hypothetical protein  31.94 
 
 		 73 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24630  hypothetical protein  31.94 
 
 		 93 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3012  hypothetical protein  33.33 
 
 		 73 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.320414  decreased coverage  0.00000000000000430073 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1675  hypothetical protein  30.99 
 
 		 72 aa  47  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0116343  normal  0.567132 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1750  hypothetical protein  30.99 
 
 		 72 aa  47  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000194255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1780  hypothetical protein  30.99 
 
 		 72 aa  47  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0375803  normal  0.0296624 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1547  hypothetical protein  37.93 
 
 		 74 aa  46.2  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1997  hypothetical protein  30.56 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000000669002  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2598  hypothetical protein  30 
 
 		 71 aa  45.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02006  hypothetical protein  38.89 
 
 		 80 aa  44.3  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000861224  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2476  hypothetical protein  31.34 
 
 		 75 aa  43.5  0.0009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003434  hypothetical protein  29.17 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.880664  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2807  hypothetical protein  35.82 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.244352  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1101  hypothetical protein  29.17 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1804  hypothetical protein  27.69 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00318058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2200  hypothetical protein  26.67 
 
 		 77 aa  40.4  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>