19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02006 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02006  hypothetical protein  100 
 
 		 80 aa  165  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000861224  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1997  hypothetical protein  40.58 
 
 		 73 aa  66.6  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000000669002  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1547  hypothetical protein  31.51 
 
 		 74 aa  59.3  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1101  hypothetical protein  36.23 
 
 		 78 aa  55.1  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003434  hypothetical protein  36.23 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.880664  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1131  hypothetical protein  38.89 
 
 		 74 aa  44.3  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637215  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1780  hypothetical protein  31.43 
 
 		 72 aa  43.5  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0375803  normal  0.0296624 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1675  hypothetical protein  31.43 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0116343  normal  0.567132 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1750  hypothetical protein  31.43 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000194255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1749  hypothetical protein  26.67 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1055  hypothetical protein  38.18 
 
 		 72 aa  41.6  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.231807  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2958  hypothetical protein  31.43 
 
 		 72 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24630  hypothetical protein  27.87 
 
 		 93 aa  41.2  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2598  hypothetical protein  31.88 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2086  hypothetical protein  27.87 
 
 		 73 aa  40.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2135  hypothetical protein  28.79 
 
 		 74 aa  40.4  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.141239  normal  0.38352 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2481  hypothetical protein  23.19 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00238478  hitchhiker  0.00335305 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2200  hypothetical protein  31.43 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2476  hypothetical protein  33.33 
 
 		 75 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>