More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0303 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0303  phosphate transporter  100 
 
 
371 aa  715    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2816  phosphate transporter  48.4 
 
 
325 aa  307  2.0000000000000002e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3798  phosphate transporter  41.24 
 
 
319 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0952  phosphate transporter  29.06 
 
 
336 aa  110  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.775195  normal  0.447908 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3185  phosphate transporter  27.45 
 
 
336 aa  105  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.987096 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1646  phosphate transporter  29.05 
 
 
329 aa  102  8e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0492  phosphate transporter  26.72 
 
 
401 aa  100  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000002295  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0717  phosphate transporter  29.75 
 
 
337 aa  99.8  7e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2020  pho4 family protein  28.74 
 
 
433 aa  99  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2499  phosphate transporter  29.97 
 
 
346 aa  98.2  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.617445  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0716  phosphate transporter  28.5 
 
 
422 aa  98.2  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000146128  unclonable  0.000000015476 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004529  probable low-affinity inorganic phosphate transporter  28.95 
 
 
419 aa  98.6  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000555877  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1960  phosphate transporter  27.99 
 
 
334 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2682  putative phosphate transporter  29.05 
 
 
428 aa  98.2  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0631153  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1527  phosphate transporter  30.38 
 
 
411 aa  96.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.331212  normal  0.0143461 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2385  phosphate transporter  26.37 
 
 
332 aa  95.5  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.883996 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3761  putative low-affinity phosphate transport protein  27.72 
 
 
336 aa  95.1  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253043  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1966  phosphate transporter  26.77 
 
 
391 aa  95.1  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0416469 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0911  phosphate transporter  29.1 
 
 
378 aa  94.4  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2045  phosphate transporter  28.08 
 
 
346 aa  93.2  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000973225  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1399  phosphate transporter  27.76 
 
 
336 aa  92  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00862  hypothetical protein  28.06 
 
 
419 aa  90.9  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0775  phosphate transporter  40 
 
 
328 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.123226 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12304  phosphate-transport system permease pitB  36.08 
 
 
552 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2469  phosphate transporter  28.54 
 
 
423 aa  90.1  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0762  phosphate transporter  28.48 
 
 
343 aa  89.7  7e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.217274  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1678  phosphate transporter  38.51 
 
 
334 aa  89.7  8e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.397083  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0633  hypothetical protein  26.52 
 
 
417 aa  89.4  9e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3637  phosphate transporter family protein  27.61 
 
 
431 aa  89.4  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0283  phosphate transporter  27.1 
 
 
334 aa  89.4  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0849813 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10556  low affinity inorganic phosphate transporter integral membrane protein pitA  28.88 
 
 
417 aa  89  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0205313  normal  0.167951 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1798  phosphate transporter  26.89 
 
 
434 aa  89.4  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000136654 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0190  phosphate transporter  25.95 
 
 
336 aa  89  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.177955 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0352  phosphate transporter  27.64 
 
 
423 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1147  phosphate transporter  26.68 
 
 
411 aa  89  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.367938  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2189  phosphate transporter family protein  27.49 
 
 
417 aa  88.2  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3015  putative low-affinity phosphate transporter lipoprotein transmembrane  25.53 
 
 
336 aa  88.2  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360288  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0043  phosphate transporter  25 
 
 
331 aa  87.8  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0168  phosphate transporter family protein  32.05 
 
 
397 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0294  phosphate transporter family protein  32.05 
 
 
380 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4358  phosphate transporter  27.06 
 
 
335 aa  88.2  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000836516  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1922  phosphate transporter  27.75 
 
 
397 aa  88.2  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00186941  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00270  phosphate/sulfate permease  48.15 
 
 
539 aa  88.6  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.382263 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0137  low-affinity inorganic phosphate transporter  27.49 
 
 
417 aa  88.6  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0229  phosphate transporter  26.56 
 
 
422 aa  88.2  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.81942  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0916  phosphate transporter  26.57 
 
 
429 aa  87.8  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000785121  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2658  phosphate transporter  26.53 
 
 
332 aa  87.4  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2335  phosphate transporter  36.36 
 
 
336 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.90978  normal  0.624995 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3456  phosphate transporter  26.57 
 
 
429 aa  87.8  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000664139  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1191  phosphate permease  27.16 
 
 
420 aa  87.8  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3097  phosphate transporter  26.09 
 
 
429 aa  87.4  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000238247  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0566  phosphate transporter  28.04 
 
 
422 aa  87.8  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0906  phosphate transporter  26.57 
 
 
429 aa  87.8  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000184742  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0882  phosphate transporter  26.57 
 
 
429 aa  87.8  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102978  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3781  sodium/phosphate symporter  27.67 
 
 
411 aa  87.4  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2031  phosphate transporter  36.65 
 
 
334 aa  87  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08680  phosphate/sulfate permease  37.5 
 
 
599 aa  87  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.093413  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0326  phosphate transporter  26.65 
 
 
334 aa  86.7  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000822129 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0852  phosphate transporter  26.09 
 
 
429 aa  86.7  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000695  normal  0.426363 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2523  phosphate transporter  36.65 
 
 
338 aa  86.3  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0983692  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0788  phosphate transporter  35.54 
 
 
535 aa  86.3  8e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0617  hypothetical protein  26.28 
 
 
417 aa  85.9  9e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0617  phosphate transporter  26.2 
 
 
422 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00080606  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1237  phosphate transporter  28.3 
 
 
326 aa  85.5  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1053  phosphate transporter  29.85 
 
 
416 aa  85.9  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.036629  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3120  phosphate transporter  26.09 
 
 
429 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000658965  normal  0.231451 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2117  phosphate transporter  22.97 
 
 
332 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0147275  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0031  phosphate transporter  29.54 
 
 
333 aa  85.9  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.952576  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5202  phosphate transporter  37.42 
 
 
334 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.204566 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1313  inorganic phosphate transporter  26.02 
 
 
336 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5972  phosphate transporter  38.51 
 
 
334 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.115846 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0716  inorganic phosphate transporter  33.33 
 
 
535 aa  84.7  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0400057  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3488  phosphate transporter  27.21 
 
 
422 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000339536  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0691  phosphate transporter  33.33 
 
 
535 aa  84.7  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1973  phosphate transporter  26.44 
 
 
336 aa  85.1  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137015  normal  0.10663 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0821  phosphate transporter  26.09 
 
 
429 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.247427 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1631  phosphate transporter  38.74 
 
 
521 aa  85.5  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3393  phosphate transporter  38 
 
 
334 aa  85.1  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0414241  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1485  phosphate transporter  26.09 
 
 
332 aa  84.3  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000164623  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1123  phosphate transporter  26.49 
 
 
335 aa  84.3  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000161634  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3225  phosphate transporter  24.75 
 
 
411 aa  84  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1414  phosphate transporter  36.25 
 
 
329 aa  84  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3844  phosphate transporter  26.33 
 
 
422 aa  84  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000689956  hitchhiker  0.0000000351014 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1443  phosphate transporter  25.19 
 
 
373 aa  83.6  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.315159  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2946  phosphate transporter  35.37 
 
 
334 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.747547  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1129  phosphate-transport permease PitB  37.62 
 
 
522 aa  83.2  0.000000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.371556  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3771  phosphate transporter, putative  26.33 
 
 
424 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0691  phosphate transporter  26.29 
 
 
422 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000075079  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4378  phosphate transporter  24.62 
 
 
353 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0749407 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3319  phosphate transporter  26.51 
 
 
422 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1038  phosphate transporter  29.37 
 
 
394 aa  81.6  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.277107  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1188  phosphate transporter  26.29 
 
 
336 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.198901  normal  0.0620893 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1404  phosphate transporter  26.81 
 
 
336 aa  81.6  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1249  phosphate transporter  26.29 
 
 
336 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0366515  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1470  phosphate transporter  25.59 
 
 
336 aa  81.6  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0688  phosphate transporter  25.54 
 
 
335 aa  81.3  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000897538  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3358  phosphate transporter  25.48 
 
 
336 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.450825 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0703  phosphate transporter  25.54 
 
 
335 aa  81.3  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000147408  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2706  phosphate transporter  25.48 
 
 
336 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.906266  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5472  phosphate transporter  36.2 
 
 
333 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.57273 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>