22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_32164 on replicon NC_009360
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009360  OSTLU_32164  predicted protein  100 
 
 
198 aa  400  1e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0223529 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46889  predicted protein  35.26 
 
 
336 aa  103  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.824885  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46890  predicted protein  32.79 
 
 
257 aa  94  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.103921  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27528  predicted protein  29.91 
 
 
166 aa  56.6  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.189513  normal  0.419677 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5558  excinuclease ABC subunit C  41.79 
 
 
90 aa  51.6  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3617  putative excinuclease, subunit C  38.81 
 
 
98 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1139  Excinuclease ABC C subunit domain protein  41.43 
 
 
80 aa  46.6  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138973  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0126  hypothetical protein  27.71 
 
 
82 aa  46.2  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1970  Excinuclease ABC C subunit domain protein  36.36 
 
 
121 aa  45.8  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.712679  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1009  Excinuclease ABC C subunit domain protein  37.7 
 
 
92 aa  45.8  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.53905  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03940  Excinuclease ABC C subunit domain protein  31.88 
 
 
86 aa  44.7  0.0009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2420  excinuclease ABC subunit C  38.33 
 
 
285 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.180406 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1804  excinuclease ABC subunit C  38.33 
 
 
295 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2416  excinuclease ABC subunit C  38.33 
 
 
299 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3608  GIY-YIG nuclease superfamily protein  40 
 
 
88 aa  43.9  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.942188  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1952  Excinuclease ABC C subunit domain protein  38.24 
 
 
130 aa  42.4  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0522  excinuclease ABC subunit C  29.69 
 
 
82 aa  42.4  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.199527  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0509  excinuclease ABC subunit C  29.69 
 
 
82 aa  42.4  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.107949  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5743  excinuclease ABC subunit C  36.67 
 
 
289 aa  42.4  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.6194  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2326  excinuclease ABC subunit C  36.67 
 
 
291 aa  42  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2011  endonuclease  23.4 
 
 
98 aa  42  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000274341  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2461  excinuclease ABC subunit C  36.67 
 
 
296 aa  41.6  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.976587  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>