44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_t0781 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_t0781  tRNA-Gly  100 
 
 
72 bp  143  6e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0621969  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0177  tRNA-Gly  90.57 
 
 
72 bp  65.9  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0028  tRNA-Gly  90.57 
 
 
72 bp  65.9  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000877648  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1225  tRNA-Gly  86.11 
 
 
72 bp  63.9  0.000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.199652  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0068  tRNA-Gly  89.29 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00365529  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0029  tRNA-Gly  97.14 
 
 
72 bp  61.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0035  tRNA-Gly  97.14 
 
 
72 bp  61.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0050  tRNA-Gly  91.3 
 
 
72 bp  60  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0034  tRNA-Gly  91.3 
 
 
72 bp  60  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0105  tRNA-Gly  91.3 
 
 
72 bp  60  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.904682  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  91.3 
 
 
75 bp  60  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0094  tRNA-Gly  91.3 
 
 
72 bp  60  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000022711  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0040  tRNA-Gly  91.3 
 
 
72 bp  60  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0631602  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0021  tRNA-Gly  91.3 
 
 
75 bp  60  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.101366  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  91.3 
 
 
75 bp  60  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000588237  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  84.72 
 
 
72 bp  56  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  84.72 
 
 
72 bp  56  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0612672  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0003  tRNA-Gly  96.77 
 
 
75 bp  54  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.760714  normal  0.382558 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07693  tRNA-Gly  92.11 
 
 
73 bp  52  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0112  tRNA-Gly  89.13 
 
 
72 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  91.89 
 
 
72 bp  50.1  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000495704  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0046  tRNA-Gly  93.55 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0007  tRNA-Gly  93.55 
 
 
72 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.864337  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0046  tRNA-Gly  93.55 
 
 
72 bp  46.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000316882 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0063  tRNA-Gly  93.55 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0003  tRNA-Gly  93.55 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0032  tRNA-Gly  93.55 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAGlyVIMSS1309207  tRNA-Gly  93.55 
 
 
72 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0008  tRNA-Gly  93.55 
 
 
72 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.612025 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0044  tRNA-Gly  93.55 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0042  tRNA-Gly  93.55 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0039  tRNA-Gly  93.55 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.52973  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0044  tRNA-Gly  93.55 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAGlyVIMSS1309383  tRNA-Gly  93.55 
 
 
72 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120568 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0025  tRNA-Gly  93.55 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0712704 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0170  tRNA-Gly  86.96 
 
 
72 bp  44.1  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0026  tRNA-Gly  86.96 
 
 
72 bp  44.1  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1613  tRNA-Gly  86.96 
 
 
72 bp  44.1  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.610826 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1578  tRNA-Gly  86.96 
 
 
72 bp  44.1  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0281  tRNA-Gly  86.96 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000381106  hitchhiker  0.0000254958 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0055  tRNA-Gly  89.47 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.835398  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0085  tRNA-Gly  86.96 
 
 
72 bp  44.1  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000120136  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0059  tRNA-Gly  86.96 
 
 
72 bp  44.1  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336039  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0030  tRNA-Gly  86.96 
 
 
72 bp  44.1  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>