21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2230 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2230  hypothetical protein  100 
 
 
430 aa  863    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.615453  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2630  hypothetical protein  87.18 
 
 
454 aa  742    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31513  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5286  hypothetical protein  23.53 
 
 
431 aa  79.7  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.32718 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1126  Protein of unknown function DUF2029  29.13 
 
 
425 aa  60.5  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2198  hypothetical protein  30.23 
 
 
408 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2000  hypothetical protein  29.11 
 
 
439 aa  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.846413  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4044  hypothetical protein  29.49 
 
 
442 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345379  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6115  hypothetical protein  27.95 
 
 
479 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112096  normal  0.027736 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0455  mannosyltransferase  29.94 
 
 
422 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0479  mannosyltransferase  29.94 
 
 
422 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0468  mannosyltransferase  29.94 
 
 
422 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5329  hypothetical protein  27.93 
 
 
478 aa  46.6  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4234  sugar transporter superfamily protein  27.38 
 
 
402 aa  46.6  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.350034  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4089  hypothetical protein  28 
 
 
408 aa  44.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0942983  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4322  mannosyltransferase  29.49 
 
 
417 aa  44.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2282  Protein of unknown function DUF2029  31.37 
 
 
469 aa  44.7  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291881  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2153  mannosyltransferase  28.74 
 
 
369 aa  44.3  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0955915  normal  0.0100871 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12209  integral membrane protein  30 
 
 
427 aa  44.3  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5433  hypothetical protein  31.45 
 
 
420 aa  43.9  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21610  Protein of unknown function (DUF2029)  28.04 
 
 
421 aa  43.9  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0338543  normal  0.0110628 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3880  putative conserved membrane protein  33.54 
 
 
375 aa  43.5  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561968 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>