77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0777 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_3446  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  88.01 
 
 
342 aa  634    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.501615  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0777  nitrate reductase, delta subunit  100 
 
 
342 aa  704    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0331  respiratory nitrate reductase chaperone NarJ  32.41 
 
 
206 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000424916 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0205  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  38.53 
 
 
181 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2654  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  36.96 
 
 
177 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2805  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  38.83 
 
 
242 aa  65.5  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.441346  normal  0.0319013 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0507  respiratory nitrate reductase chaperone NarJ  31.82 
 
 
226 aa  59.3  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.993559  normal  0.350647 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1237  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  33.06 
 
 
248 aa  58.2  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.837761  normal  0.358229 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1826  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  42.03 
 
 
237 aa  55.8  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.909351  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1777  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  36.67 
 
 
182 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.428045  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2172  respiratory nitrate reductase chaperone NarJ  36.67 
 
 
182 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.270785  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1706  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  35.56 
 
 
182 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.887817  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0273  respiratory nitrate reductase, delta subunit  27.41 
 
 
235 aa  53.9  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0297  respiratory nitrate reductase, delta subunit  27.41 
 
 
235 aa  53.9  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4476  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  32.84 
 
 
223 aa  53.1  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5443  respiratory nitrate reductase, delta subunit  32.26 
 
 
208 aa  53.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.247516  normal  0.223039 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3401  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  29.84 
 
 
181 aa  53.5  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1405  respiratory nitrate reductase chaperone NarJ  26.02 
 
 
215 aa  53.1  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.688747  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0248  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  34.52 
 
 
177 aa  52.8  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.3038  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2234  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  29.29 
 
 
226 aa  51.6  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1529  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  28.93 
 
 
183 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000139315  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2038  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  31.25 
 
 
207 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1332  respiratory nitrate reductase chaperone NarJ  30.23 
 
 
259 aa  52  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2637  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  29.51 
 
 
191 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2137  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  29.84 
 
 
177 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0194  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  29.27 
 
 
223 aa  50.8  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107326  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1761  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  37.33 
 
 
226 aa  51.2  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.441918  decreased coverage  0.00271528 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4427  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  30.36 
 
 
244 aa  50.8  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205722  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3701  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  33.33 
 
 
221 aa  50.4  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0179  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  30.71 
 
 
223 aa  50.4  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121896  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1910  hypothetical protein  38.1 
 
 
96 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3178  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  28.23 
 
 
176 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3084  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  27.34 
 
 
246 aa  49.7  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.767842  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1934  nitrate reductase, delta subunit  30.65 
 
 
176 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.395358  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2893  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  28.15 
 
 
236 aa  49.3  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.174317  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2127  nitrate reductase delta chain  30.65 
 
 
176 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1852  nitrate reductase, delta subunit  34.04 
 
 
234 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2160  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  30.65 
 
 
176 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1956  nitrate reductase, delta subunit  30.65 
 
 
176 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0503251  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1979  nitrate reductase delta chain  30.65 
 
 
176 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5211  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  29.5 
 
 
221 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.578691 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5709  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  29.92 
 
 
233 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.839113  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6462  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  29.92 
 
 
233 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.131783  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2632  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  24.62 
 
 
243 aa  47.8  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.227411  normal  0.019972 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2277  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  32.91 
 
 
176 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5004  respiratory nitrate reductase chaperone NarJ  28.46 
 
 
225 aa  47.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.529974  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0976  putative respiratory nitrate reductase oxidoreductase protein  30.66 
 
 
226 aa  47  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1001  respiratory nitrate reductase chaperone NarJ  26.61 
 
 
231 aa  47  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.873205  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1922  nitrate reductase delta subunit protein  40 
 
 
192 aa  47  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2627  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  29.85 
 
 
234 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.396809  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1516  nitrate reductase, delta subunit  30 
 
 
234 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.230048  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1348  respiratory nitrate reductase chaperone NarJ  35.71 
 
 
236 aa  46.6  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2243  nitrate reductase, delta subunit  30 
 
 
234 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0183466  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3075  nitrate reductase, delta subunit  30 
 
 
234 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.416699  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3673  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  29.57 
 
 
237 aa  46.6  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.102496  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2683  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  30 
 
 
234 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1733  nitrate reductase, delta subunit  30 
 
 
234 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1207  respiratory nitrate reductase chaperone NarJ  34.44 
 
 
205 aa  46.2  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.17695  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1956  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  26.23 
 
 
244 aa  46.6  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.389799 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1583  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  27.61 
 
 
218 aa  46.2  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000370906  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2590  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  28.15 
 
 
248 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2158  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  34.67 
 
 
221 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0149092 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1973  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  31.25 
 
 
176 aa  45.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5385  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  28.24 
 
 
230 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0946218  normal  0.0190319 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2759  nitrate reductase, delta subunit  30.08 
 
 
238 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.639907  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11188  respiratory nitrate reductase delta subunit narJ  29.13 
 
 
201 aa  43.9  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2076  respiratory nitrate reductase chaperone NarJ  32.14 
 
 
219 aa  43.9  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0305545  normal  0.113885 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18700  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  33.33 
 
 
284 aa  43.9  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0833774  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0902  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  36.36 
 
 
237 aa  43.9  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03845  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  22.46 
 
 
246 aa  43.9  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2518  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  26.27 
 
 
242 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.224808  normal  0.707625 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3597  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  29.17 
 
 
184 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00865083 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1909  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  31.09 
 
 
179 aa  42.7  0.008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1278  respiratory nitrate reductase chaperone NarJ  36.07 
 
 
217 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.249883 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2975  hypothetical protein  31.51 
 
 
104 aa  42.7  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.398445  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1261  respiratory nitrate reductase chaperone NarJ  36.07 
 
 
217 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0454971  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2881  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  28.46 
 
 
240 aa  42.4  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>