24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4417 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4417  nuclear transport factor 2  100 
 
 		 150 aa  310  4.999999999999999e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1249  hypothetical protein  49.32 
 
 		 147 aa  134  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.64479  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3853  hypothetical protein  42.96 
 
 		 136 aa  105  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2441  hypothetical protein  37.5 
 
 		 133 aa  99  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.655393  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3969  hypothetical protein  37.14 
 
 		 149 aa  97.4  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15097  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5165  nuclear transport factor 2  34.4 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1592  nuclear transport factor 2  33.33 
 
 		 144 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4969  nuclear transport factor 2  32.85 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.929355 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4674  nuclear transport factor 2  32.12 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4586  nuclear transport factor 2  32.12 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10775  hypothetical protein  32.82 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4214  nuclear transport factor 2  32.52 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4370  nuclear transport factor 2  32.52 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0442394  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4139  nuclear transport factor 2  32.52 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478479  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4664  nuclear transport factor 2  30.47 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.863106 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2053  nuclear transport factor 2  30.53 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.153655 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3954  nuclear transport factor 2  30.89 
 
 		 124 aa  47  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199475  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2031  putative ketosteroid isomerase  20.63 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4294  putative phenazine biosynthesis protein  25.45 
 
 		 143 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.762733  normal  0.0227687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3295  nuclear transport factor 2  28.33 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.168461 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4985  steroid delta-5-3-ketosteroid isomerase  26.13 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2918  nuclear transport factor 2  40 
 
 		 274 aa  40  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.200608 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2932  nuclear transport factor 2  40 
 
 		 274 aa  40  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2888  nuclear transport factor 2  40 
 
 		 274 aa  40  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0754079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>