20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2998 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2998  hypothetical protein  100 
 
 
1342 aa  2587    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0440986  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0189  hypothetical protein  40.06 
 
 
1435 aa  644    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335759  normal  0.93166 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0207  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  39.69 
 
 
1435 aa  677    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.608322 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3992  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.22 
 
 
1430 aa  559  1e-157  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.589643  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0805  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  37.08 
 
 
1371 aa  550  1e-155  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4462  hypothetical protein  34.36 
 
 
1435 aa  543  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.8881  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0216  putative transmembrane protein  35.94 
 
 
1384 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0226  putative transmembrane protein  36.13 
 
 
1384 aa  513  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0236  putative transmembrane protein  36.13 
 
 
1384 aa  513  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.635467 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2467  hypothetical protein  35.15 
 
 
1403 aa  506  1e-141  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3706  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.2 
 
 
1506 aa  486  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0418  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.36 
 
 
1404 aa  489  1e-136  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1471  hypothetical protein  35.06 
 
 
1345 aa  487  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.984073 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10238  transmembrane protein  35.14 
 
 
1400 aa  486  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0418  putative transmembrane protein  33.17 
 
 
1347 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0280672  normal  0.0494361 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0253  putative transmembrane protein  34.08 
 
 
1408 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640181  normal  0.103172 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5301  hypothetical protein  33.63 
 
 
1312 aa  343  9e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.437695  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1165  hypothetical protein  33.54 
 
 
1322 aa  331  6e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0368185  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1050  hypothetical protein  25.73 
 
 
1608 aa  169  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5501  hypothetical protein  25.9 
 
 
1672 aa  152  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.627379  normal  0.180231 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>