26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1222 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1222  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  324  4.0000000000000003e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1223  hypothetical protein  43.95 
 
 
163 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08430  Protein of unknown function (DUF2505)  33.74 
 
 
170 aa  75.5  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2830  hypothetical protein  30.86 
 
 
168 aa  67.8  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.257591  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4964  hypothetical protein  28.95 
 
 
164 aa  62.4  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6762  hypothetical protein  30.06 
 
 
165 aa  63.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2398  Protein of unknown function DUF2505  33.77 
 
 
171 aa  62.4  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0024135 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0779  Protein of unknown function DUF2505  32.03 
 
 
166 aa  57  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.242967  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20520  Protein of unknown function (DUF2505)  28.57 
 
 
168 aa  54.3  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0605599  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2610  hypothetical protein  29.09 
 
 
170 aa  53.5  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.122572  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1296  proteinase inhibitor I25 cystatin  27.81 
 
 
165 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0822  hypothetical protein  26.67 
 
 
168 aa  52  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1815  Protein of unknown function DUF2505  27.61 
 
 
394 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.553226  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08750  Protein of unknown function (DUF2505)  20.99 
 
 
164 aa  50.1  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.131074  normal  0.590298 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1241  hypothetical protein  24.22 
 
 
176 aa  48.5  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.630151  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0665  hypothetical protein  30.77 
 
 
169 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0160914  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0645  hypothetical protein  30.77 
 
 
169 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0644  hypothetical protein  23.17 
 
 
167 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.125021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0652  hypothetical protein  30.77 
 
 
169 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196949  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0651  hypothetical protein  22.56 
 
 
167 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100423  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0664  hypothetical protein  22.56 
 
 
167 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0157573  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0091  hypothetical protein  27.69 
 
 
173 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0780  Protein of unknown function DUF2505  23.9 
 
 
169 aa  43.9  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.576817  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3048  hypothetical protein  26.04 
 
 
162 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.323444  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05540  hypothetical protein  24 
 
 
175 aa  42.7  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02610  Protein of unknown function (DUF2505)  25.9 
 
 
164 aa  40.4  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.344177  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>