26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2680 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2680  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  240  3.9999999999999997e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.776362  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0651  hypothetical protein  55.37 
 
 
124 aa  120  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0781169  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3753  putative transmembrane protein  50 
 
 
129 aa  117  7e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.196482  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4830  putative transmembrane protein  50 
 
 
129 aa  117  7e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.973163  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7087  putative transmembrane protein  52.5 
 
 
123 aa  110  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2350  hypothetical protein  55 
 
 
123 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2488  hypothetical protein  55 
 
 
123 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0109549  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0805  hypothetical protein  55 
 
 
220 aa  107  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03755  hypothetical protein  50.85 
 
 
122 aa  105  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3704  hypothetical protein  47.24 
 
 
146 aa  101  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.385221 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2574  hypothetical protein  42.5 
 
 
138 aa  85.5  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2339  hypothetical protein  37.5 
 
 
133 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.964598  normal  0.0789899 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2717  hypothetical protein  37.5 
 
 
133 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.22005  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3285  hypothetical protein  39.13 
 
 
120 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1613  hypothetical protein  36.96 
 
 
121 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000288043  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0518  hypothetical protein  32.76 
 
 
131 aa  46.2  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1626  hypothetical protein  36.05 
 
 
125 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.341963  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2578  hypothetical protein  36.9 
 
 
119 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000124522  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1176  hypothetical protein  34.41 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0740486  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1175  hypothetical protein  33.33 
 
 
128 aa  44.7  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0936518  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1113  hypothetical protein  38.46 
 
 
123 aa  43.5  0.0009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3110  hypothetical protein  33.73 
 
 
120 aa  42  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4875  hypothetical protein  30.7 
 
 
142 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.701798 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20280  hypothetical protein  36.71 
 
 
121 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.333652  normal  0.366346 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3754  hypothetical protein  33.72 
 
 
126 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35010  hypothetical protein  36.05 
 
 
119 aa  40.4  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0381514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>