12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1787 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1787  AN1-type Zinc finger protein  100 
 
 		 73 aa  151  4e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0599  AN1-type Zinc finger protein  50 
 
 		 321 aa  55.5  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.715069  normal  0.614872 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2451  Rhomboid family protein  41.07 
 
 		 326 aa  55.1  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2282  Allergen V5/Tpx-1 family protein  50 
 
 		 348 aa  54.7  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2965  Rhomboid family protein  38.6 
 
 		 318 aa  53.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.58204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2949  AN1-type Zinc finger protein  36.62 
 
 		 90 aa  50.8  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2632  Rhomboid family protein  45.95 
 
 		 310 aa  50.1  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2261  Zinc finger, AN1-type  50 
 
 		 415 aa  46.6  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48928  predicted protein  42.55 
 
 		 299 aa  45.4  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.710722 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1128  Rhomboid family protein  40.54 
 
 		 319 aa  45.1  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0458  Zinc finger, AN1-type  33.87 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  48.15 
 
 		 279 aa  40.4  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>