28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1692 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1692  H+transporting two-sector ATPase E subunit  100 
 
 
198 aa  392  1e-108  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.671427 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1434  V-type ATP synthase subunit E  28.8 
 
 
207 aa  61.2  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1374  H+transporting two-sector ATPase E subunit  27.66 
 
 
193 aa  55.1  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3350  H+transporting two-sector ATPase E subunit  26.95 
 
 
193 aa  53.9  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2318  H+-transporting two-sector ATPase, E subunit  23.33 
 
 
188 aa  53.1  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.369996  hitchhiker  0.000392514 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1278  V-type ATP synthase subunit E  29.77 
 
 
194 aa  53.1  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1773  H+-transporting two-sector ATPase, E subunit  24.34 
 
 
200 aa  51.6  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0062  H+transporting two-sector ATPase E subunit  23.12 
 
 
203 aa  51.6  0.000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2264  H+-transporting two-sector ATPase, E subunit  30.07 
 
 
198 aa  50.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1960  H+transporting two-sector ATPase E subunit  26.06 
 
 
190 aa  50.1  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.73432  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0218  H+transporting two-sector ATPase E subunit  25.45 
 
 
212 aa  50.4  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1612  V-type ATP synthase subunit E  25.6 
 
 
182 aa  49.7  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.923493  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2084  H+-transporting two-sector ATPase, E subunit  28.28 
 
 
212 aa  48.1  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.490095  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1893  V-type ATPase, E subunit  26.13 
 
 
198 aa  48.1  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2088  H+-transporting two-sector ATPase, E subunit  26.36 
 
 
190 aa  48.1  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1612  V-type ATPase, E subunit  26.13 
 
 
198 aa  48.1  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0295  H+transporting two-sector ATPase E subunit  24.49 
 
 
203 aa  46.6  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.616118 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1240  V-type ATP synthase subunit E  29.05 
 
 
183 aa  46.6  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19410  V-type ATP synthase subunit E  19.28 
 
 
202 aa  47  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0706  H+-transporting two-sector ATPase, E subunit  27.82 
 
 
190 aa  46.6  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0351771 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0364  H+transporting two-sector ATPase E subunit  24 
 
 
203 aa  46.2  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.285147  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0278  V-type ATP synthase subunit E  25.43 
 
 
192 aa  46.2  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.591531 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0552  H+-transporting two-sector ATPase, E subunit  24.49 
 
 
203 aa  46.6  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1618  H+transporting two-sector ATPase E subunit  24.49 
 
 
203 aa  45.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.620673  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1219  hypothetical protein  31.2 
 
 
192 aa  45.4  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000580099  normal  0.235288 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0389  V-type ATP synthase subunit E  24.83 
 
 
183 aa  43.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1629  H+transporting two-sector ATPase E subunit  20.59 
 
 
194 aa  41.6  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.10454  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_7408  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  29.01 
 
 
216 aa  41.6  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.161915  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>