17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1893 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1893  V-type ATPase, E subunit  100 
 
 		 198 aa  380  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1612  V-type ATPase, E subunit  99.49 
 
 		 198 aa  378  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2264  H+-transporting two-sector ATPase, E subunit  41.72 
 
 		 198 aa  97.4  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2367  H+-transporting two-sector ATPase, E subunit  34.67 
 
 		 200 aa  92.8  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0855  H+transporting two-sector ATPase E subunit  28.35 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0062  H+transporting two-sector ATPase E subunit  31.03 
 
 		 203 aa  61.2  0.000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0364  H+transporting two-sector ATPase E subunit  28.5 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.285147  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1618  H+transporting two-sector ATPase E subunit  29.53 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.620673  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0552  H+-transporting two-sector ATPase, E subunit  29.53 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0295  H+transporting two-sector ATPase E subunit  29.95 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.616118 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0253  hypothetical protein  30 
 
 		 182 aa  57  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1692  H+transporting two-sector ATPase E subunit  26.13 
 
 		 198 aa  48.1  0.00007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.671427 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0813  H+-transporting two-sector ATPase, E subunit  28.21 
 
 		 215 aa  48.1  0.00009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0278  V-type ATP synthase subunit E  21.11 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.591531 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3075  H+transporting two-sector ATPase E subunit  28.36 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19410  V-type ATP synthase subunit E  29.59 
 
 		 202 aa  43.9  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1689  H+transporting two-sector ATPase E subunit  22.84 
 
 		 183 aa  44.3  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>