25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1153 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1153  high-affinity nickel-transporter  100 
 
 		 233 aa  455  1e-127  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.608233 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3876  high-affinity nickel-transporter  35.47 
 
 		 232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1851  high-affinity nickel-transporter  34.76 
 
 		 231 aa  121  9e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0801332  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3913  high-affinity nickel-transporter  33.89 
 
 		 238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2766  urease accessory protein  38.22 
 
 		 207 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3212  high-affinity nickel-transporter  30.99 
 
 		 239 aa  106  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0923  high-affinity nickel-transporter  24.48 
 
 		 246 aa  95.9  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458788 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3875  putative urease accessory protein  29.78 
 
 		 208 aa  89.4  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1254  urease accessory protein  26.46 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.735612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3299  putative urease accessory protein  29.44 
 
 		 251 aa  82.4  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0670119  normal  0.289345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4480  hypothetical protein  27.75 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.17724  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5365  hypothetical protein  24.66 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0225  transport-associated protein  28.25 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14951  hypothetical protein  32.09 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.324822  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14811  hypothetical protein  32.29 
 
 		 223 aa  62  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.716818  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0110  high-affinity nickel-transporter  28.51 
 
 		 250 aa  61.6  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317349  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1392  hypothetical protein  33.1 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19751  hypothetical protein  30.61 
 
 		 278 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0679603 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13431  hypothetical protein  30.81 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_93398  predicted protein  23.18 
 
 		 329 aa  48.9  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1750  hydrogenase accessory protein or high-affinity nickel-transport protein homolog, membrane protein  27.17 
 
 		 222 aa  45.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.1232  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14571  hypothetical protein  28.93 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04681  hypothetical protein  27.84 
 
 		 222 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.668858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47092  predicted protein  26.09 
 
 		 292 aa  42.7  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48510  predicted protein  22.63 
 
 		 309 aa  41.6  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>