11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0876 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0876  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  230  6e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.195647 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0877  putative transcriptional regulator  48.51 
 
 		 110 aa  103  8e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.199532 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1362  hypothetical protein  35.71 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.483712 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1152  hypothetical protein  32.53 
 
 		 89 aa  47.4  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.314563 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1445  transcriptional regulator, ArsR family  28.87 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481445  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0442  regulatory protein ArsR  30.12 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0690  hypothetical protein  28.92 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1306  hypothetical protein  29.17 
 
 		 116 aa  43.9  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000189351 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0559  transcription regulator  25.77 
 
 		 116 aa  43.9  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.4185 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1741  hypothetical protein  26.44 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0147  hypothetical protein  28.17 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>