45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3042 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_3042  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  100 
 
 
391 aa  792    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5114  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  55.08 
 
 
391 aa  396  1e-109  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2644  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  27.75 
 
 
397 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.131572  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1960  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  25.14 
 
 
402 aa  99.4  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.244976  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2611  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  26.98 
 
 
389 aa  90.5  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2730  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  27.47 
 
 
396 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.156548  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2825  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  27.47 
 
 
396 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.18078  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2016  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  26.79 
 
 
388 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0529059 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1567  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  24.4 
 
 
410 aa  81.6  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0505  hypothetical protein  29.79 
 
 
358 aa  62  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.620717  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2370  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  25.45 
 
 
411 aa  59.7  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0682  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  26.06 
 
 
440 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.85298 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0486  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.17 
 
 
429 aa  58.2  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00765759  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07761  hypothetical protein  20.92 
 
 
341 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00602159 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2855  aminotransferase family, DegT/DnrJ/EryC1/StrS  27.52 
 
 
385 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  hitchhiker  0.00000526937 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5668  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  27.52 
 
 
385 aa  55.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.01985 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1516  hypothetical protein  29.79 
 
 
372 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1911  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  25.08 
 
 
377 aa  53.1  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3064  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.08 
 
 
554 aa  53.1  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0776788  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1470  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  27.88 
 
 
376 aa  52.8  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2037  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  26.28 
 
 
371 aa  52.4  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.18877  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3183  perosamine synthetase-related protein  24.49 
 
 
316 aa  52.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3697  aminotransferase  24.05 
 
 
384 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2215  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  24.15 
 
 
412 aa  51.6  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3134  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  25.43 
 
 
368 aa  50.8  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0837  glutamine--scyllo-inositol transaminase  27.53 
 
 
433 aa  50.1  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0825  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32 
 
 
440 aa  50.1  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.677125  normal  0.765061 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2654  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  22.66 
 
 
377 aa  49.7  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0594  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  29.49 
 
 
372 aa  49.3  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2886  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  26.82 
 
 
377 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.628877  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0477  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  22.15 
 
 
364 aa  46.6  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.485963  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0289  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  24.54 
 
 
367 aa  45.8  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2624  perosamine synthase  24.05 
 
 
367 aa  46.2  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5139  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  30 
 
 
391 aa  45.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3118  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.33 
 
 
378 aa  45.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585265  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2945  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  28.57 
 
 
378 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0201539 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3346  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  27.49 
 
 
414 aa  44.3  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5670  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  27.97 
 
 
413 aa  43.5  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.42989  normal  0.0106948 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2577  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  26.59 
 
 
365 aa  43.5  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.176672  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2970  aminotransferase, DegT/DnrJ/EryC1/StrS family  24.43 
 
 
364 aa  43.5  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000014581 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0352  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  27.55 
 
 
455 aa  43.1  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.354297  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0146  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  27.45 
 
 
378 aa  43.1  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.581364  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4406  TDP-4-oxo-6-deoxy-D-glucose transaminase  32.5 
 
 
384 aa  43.1  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1512  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  27.27 
 
 
385 aa  43.1  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2600  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  27.33 
 
 
362 aa  42.7  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>