12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2949 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2949  AN1-type Zinc finger protein  100 
 
 
90 aa  187  4e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0599  AN1-type Zinc finger protein  50 
 
 
321 aa  62  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.715069  normal  0.614872 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2451  Rhomboid family protein  46.48 
 
 
326 aa  61.2  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2965  Rhomboid family protein  50 
 
 
318 aa  55.5  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.58204  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1128  Rhomboid family protein  53.85 
 
 
319 aa  55.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2632  Rhomboid family protein  51.28 
 
 
310 aa  53.5  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1787  AN1-type Zinc finger protein  36.62 
 
 
73 aa  50.8  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2282  Allergen V5/Tpx-1 family protein  48.72 
 
 
348 aa  50.8  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0458  Zinc finger, AN1-type  41.51 
 
 
111 aa  49.7  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2261  Zinc finger, AN1-type  51.35 
 
 
415 aa  48.1  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  60 
 
 
279 aa  43.5  0.0009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48928  predicted protein  36.07 
 
 
299 aa  42.7  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.710722 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>