11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1686 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_1686  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  100 
 
 		 258 aa  520  1e-146  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3614  hypothetical protein  83.2 
 
 		 258 aa  423  1e-117  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1668  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  63.16 
 
 		 251 aa  297  1e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0667  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  58.4 
 
 		 255 aa  279  3e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.286513 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2506  DNA topoisomerase I  47.37 
 
 		 250 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0335  DNA topoisomerase I  28.81 
 
 		 747 aa  60.8  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23450  topoisomerase IA  30.86 
 
 		 837 aa  46.2  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000217154  decreased coverage  0.0000000285044 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0781  DNA topoisomerase I  27.85 
 
 		 812 aa  45.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.935548  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0026  DNA topoisomerase I  29.92 
 
 		 853 aa  43.9  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0259  DNA topoisomerase type IA central domain protein  31.58 
 
 		 864 aa  43.5  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0213  DNA topoisomerase I  41.1 
 
 		 767 aa  42.7  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00304522  normal  0.312261 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>