15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0142 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0142    100 
 
 
690 bp  1368    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0709902  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0858  transposase  85.74 
 
 
681 bp  555  1e-156  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4099    84.29 
 
 
631 bp  208  2e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1894    81.43 
 
 
581 bp  163  8e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276361  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1469    87.29 
 
 
735 bp  115  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1839    78.59 
 
 
588 bp  97.6  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00715999  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2071    85.27 
 
 
185 bp  89.7  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.132995  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2554  transposase  88.73 
 
 
294 bp  77.8  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.191723 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4676    97.14 
 
 
674 bp  61.9  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3914  Integrase catalytic region  96.88 
 
 
678 bp  56  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.835776  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4863  Integrase catalytic region  96.88 
 
 
678 bp  56  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4898    96.88 
 
 
678 bp  56  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.198767  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4966  Integrase catalytic region  96.88 
 
 
678 bp  56  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4047  Integrase catalytic region  85.71 
 
 
678 bp  48.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4889    100 
 
 
728 bp  48.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.163217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>