16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2554 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2554  transposase  100 
 
 
97 aa  196  9e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.191723 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0858  transposase  73.2 
 
 
226 aa  129  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4863  Integrase catalytic region  55.79 
 
 
225 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4966  Integrase catalytic region  54.74 
 
 
225 aa  110  8.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4047  Integrase catalytic region  53.68 
 
 
225 aa  109  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3914  Integrase catalytic region  53.68 
 
 
225 aa  109  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.835776  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4959  Transposase and inactivated derivatives-like protein  52.17 
 
 
199 aa  101  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3224  transposase  51.65 
 
 
226 aa  99.4  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1903  transposase  69.84 
 
 
63 aa  85.5  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0059  IS240-type transposase (ISH102)  38.71 
 
 
206 aa  63.5  0.0000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0254142  normal  0.2099 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1494  transposase  43.59 
 
 
212 aa  62  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.913135  normal  0.873536 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1512  transposase  43.59 
 
 
212 aa  62  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0582203 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3528  transposase  43.59 
 
 
212 aa  62  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0923  transposase  39.74 
 
 
178 aa  58.9  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.134513  decreased coverage  0.0000447966 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4218  Transposase and inactivated derivatives-like protein  43.59 
 
 
205 aa  57  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0068  transposase  37.04 
 
 
211 aa  52.4  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0984567 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>