43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4053 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007959  Nham_4053  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  268  1e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.58003  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4598  transposase IS66  58 
 
 		 510 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.864978 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0650  hypothetical protein  62.5 
 
 		 117 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6322  transposase IS66  62 
 
 		 505 aa  110  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4341  transposase IS66  62 
 
 		 505 aa  110  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8372  transposase IS66  62 
 
 		 505 aa  110  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1223  IS66 family transposase  44 
 
 		 520 aa  74.7  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0185  IS66 family transposase  44 
 
 		 520 aa  74.7  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4877  transposase IS66  34.93 
 
 		 529 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386958  normal  0.659358 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0693  transposase  32.81 
 
 		 537 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3983  transposase IS66  42.05 
 
 		 461 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3724  hypothetical protein  44.3 
 
 		 527 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5560  transposase IS66  32.84 
 
 		 516 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.438701 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3220  ISPsy5, transposase  35.29 
 
 		 503 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.221861  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1086  transposase family  36.9 
 
 		 521 aa  46.2  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3169  putative IS66 transposase, TnpC  34.17 
 
 		 226 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180033  normal  0.755183 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4976  transposase IS66  29.75 
 
 		 531 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000420547  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1326  transposase IS66  39.36 
 
 		 545 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0424374 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2620  transposase IS66  30.69 
 
 		 515 aa  45.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0332564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2650  transposase IS66  30.69 
 
 		 515 aa  45.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.956476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2470  ISAfe4, transposase orf3  38.3 
 
 		 545 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1706  ISAfe4, transposase orf3  38.3 
 
 		 545 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.249951  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2093  transposase IS66  38.3 
 
 		 545 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1756  transposase IS66  38.3 
 
 		 545 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0266  transposase IS66  38.3 
 
 		 545 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5015  transposase IS66  35.4 
 
 		 549 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0609  hypothetical protein  41.27 
 
 		 234 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3307  transposase IS66  36.59 
 
 		 341 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.448509 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0556  IS66 family orf3  33.64 
 
 		 523 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.433641  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6857  transposase IS66  35 
 
 		 520 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130524  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0522  IS66 family element, orf3  33.64 
 
 		 523 aa  41.6  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.615968  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3516  IS66 Orf2 family protein  39.51 
 
 		 513 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.578775  normal  0.957908 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0171  transposase IS66  39.51 
 
 		 523 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0431  transposase IS66  39.51 
 
 		 523 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0146215 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4308  hypothetical protein  39.51 
 
 		 523 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4305  hypothetical protein  39.51 
 
 		 523 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3763  hypothetical protein  39.51 
 
 		 523 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.727828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0915  transposase IS66  39.51 
 
 		 523 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.137432 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3722  hypothetical protein  39.51 
 
 		 523 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3715  IS66 Orf2 family protein  39.51 
 
 		 523 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1419  transposase IS66  39.51 
 
 		 523 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1809  transposase IS66  39.51 
 
 		 323 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6521  transposase IS66  32.31 
 
 		 531 aa  40  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.707984  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>