26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4016 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_4016  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  257  4e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2701  hypothetical protein  88.8 
 
 		 163 aa  231  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0364226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4328  hypothetical protein  79.2 
 
 		 125 aa  214  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.363199 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1127  hypothetical protein  78.29 
 
 		 129 aa  211  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0614776  normal  0.694402 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1260  hypothetical protein  77.6 
 
 		 125 aa  209  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.357949  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1242  hypothetical protein  79.07 
 
 		 129 aa  204  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2380  hypothetical protein  90.29 
 
 		 146 aa  201  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.37673 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1477  hypothetical protein  53.12 
 
 		 146 aa  135  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2615  hypothetical protein  49.54 
 
 		 107 aa  113  8.999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0733143  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0962  hypothetical protein  42.28 
 
 		 123 aa  110  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0665  hypothetical protein  45.13 
 
 		 111 aa  107  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347875  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0671  hypothetical protein  45.79 
 
 		 127 aa  107  6e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1168  hypothetical protein  48.48 
 
 		 140 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1016  hypothetical protein  46.55 
 
 		 148 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.586424 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4669  hypothetical protein  45.26 
 
 		 149 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4300  hypothetical protein  45.26 
 
 		 151 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1064  hypothetical protein  47.42 
 
 		 144 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.589479  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4818  hypothetical protein  44.21 
 
 		 151 aa  95.1  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.530671  normal  0.143523 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3985  hypothetical protein  48.45 
 
 		 162 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.712541  decreased coverage  0.00103127 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2096  hypothetical protein  44.21 
 
 		 146 aa  92  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0697301  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1090  hypothetical protein  42.22 
 
 		 229 aa  91.3  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0715  hypothetical protein  44.33 
 
 		 214 aa  88.2  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.335973 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0709  putative signal peptide protein  46.53 
 
 		 147 aa  87.8  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.41606 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1465  hypothetical protein  41.75 
 
 		 149 aa  85.5  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0757  hypothetical protein  34.07 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0823  hypothetical protein  38 
 
 		 162 aa  53.5  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.32462  hitchhiker  0.000215418 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>