221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3725 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_3725  phosphoesterase, PA-phosphatase related  100 
 
 
158 aa  308  2e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1173  phosphoesterase PA-phosphatase related  76.58 
 
 
183 aa  231  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0920806  normal  0.0722851 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4126  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.3 
 
 
200 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7181  phosphoesterase PA-phosphatase related  36 
 
 
200 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.495224 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2302  undecaprenyl-diphosphatase  42.19 
 
 
198 aa  73.6  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0329853  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2194  PAP2 family phosphatase  34.72 
 
 
183 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000351549  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2631  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.81 
 
 
212 aa  72.8  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0399  phosphatase  35.71 
 
 
187 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.556092  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0055  undecaprenyl-diphosphatase  34.53 
 
 
200 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1456  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  40.68 
 
 
192 aa  66.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3000  PA-phosphatase-like phosphoesterase  39.34 
 
 
198 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.30971 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4035  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase (Tn6048)  39.34 
 
 
198 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4982  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase (Tn6048)  39.34 
 
 
198 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.504751  normal  0.3606 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2151  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.9 
 
 
200 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1634  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  29.5 
 
 
201 aa  66.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.550126  decreased coverage  0.000150878 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1480  undecaprenyl-diphosphatase  38 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00409552  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2676  bacitracin transport permease protein bcrc  31.69 
 
 
199 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0666  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  46.15 
 
 
160 aa  63.9  0.0000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2678  Pap2 superfamily protein, putative  36.52 
 
 
199 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0129761  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2794  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.49 
 
 
199 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.755209  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0969  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.8 
 
 
202 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0639  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.81 
 
 
185 aa  62.4  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.198264  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0901  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.77 
 
 
224 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1713  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.82 
 
 
176 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.118972  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0998  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.8 
 
 
202 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51948  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0634  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.7 
 
 
178 aa  62  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000602311  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0021  PAP2 family protein  35.14 
 
 
220 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.42598  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1017  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.8 
 
 
224 aa  62.4  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0729132  normal  0.570341 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0937  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.8 
 
 
224 aa  62.4  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2635  bacitracin transport permease protein bcrc  35.65 
 
 
199 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000183943 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2329  PAP2 family protein  33.85 
 
 
211 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.401849  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2508  PAP2 family protein  33.85 
 
 
211 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2523  PAP2 family protein  33.85 
 
 
181 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000225597 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2716  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  30.65 
 
 
199 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.179676  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2292  phosphatase, PAP2 family protein  33.85 
 
 
194 aa  59.7  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000588398  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2430  PAP2 family protein  30.65 
 
 
199 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000481219  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2391  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  30.65 
 
 
199 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.193299  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2665  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  30.65 
 
 
199 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000160204 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1557  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  31.78 
 
 
201 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2651  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  31.78 
 
 
201 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2736  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  31.78 
 
 
201 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.37805  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2248  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  30.43 
 
 
182 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1332  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  30.34 
 
 
202 aa  58.5  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.130415 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2785  bacitracin transport permease  27.67 
 
 
199 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0349348  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3127  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.82 
 
 
193 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.634869  normal  0.862887 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2053  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.21 
 
 
199 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.400178  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00808  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.11 
 
 
198 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2801  Undecaprenyl-diphosphatase  35.11 
 
 
198 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.185163  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2801  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.11 
 
 
198 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.907509 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3600  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.1 
 
 
171 aa  58.2  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000568068  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0868  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.11 
 
 
198 aa  58.2  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2504  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.11 
 
 
198 aa  58.2  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.8629  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00825  hypothetical protein  35.11 
 
 
198 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0994  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.11 
 
 
198 aa  58.2  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.485972  normal  0.103105 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0902  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.11 
 
 
198 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0843231  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0912  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.11 
 
 
198 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2759  bacitracin transport permease protein bcrc  26.75 
 
 
199 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0828321  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4984  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.07 
 
 
193 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5310  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.33 
 
 
193 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2288  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.98 
 
 
205 aa  57.4  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0272  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  26.24 
 
 
188 aa  57  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1745  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.05 
 
 
200 aa  56.6  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000013201  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2489  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.65 
 
 
199 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0315773  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1285  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.91 
 
 
192 aa  56.2  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.469864  hitchhiker  0.00228345 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2497  bacitracin transport permease  27.22 
 
 
199 aa  56.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202307  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0690  undecaprenyl-diphosphatase  30.5 
 
 
198 aa  56.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3165  undecaprenyl-diphosphatase  33.93 
 
 
193 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2462  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  26.58 
 
 
199 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0841769  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3315  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.11 
 
 
230 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.166704 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0399  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.56 
 
 
245 aa  54.7  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149101  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3387  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.3 
 
 
168 aa  54.3  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000111833  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0019  PAP2 family protein  36.94 
 
 
198 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0931  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.65 
 
 
189 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1526  PAP2 family protein  36.94 
 
 
211 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3318  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.62 
 
 
208 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0711194  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1169  PAP2 family protein  36.94 
 
 
211 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1449  PAP2 family protein  36.94 
 
 
198 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0025  PAP2 family protein  36.94 
 
 
198 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0343161  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0023  PAP2 family protein  36.94 
 
 
211 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0023  PAP2 family protein  36.94 
 
 
198 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5144  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.33 
 
 
193 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.418919  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5715  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.33 
 
 
193 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.134003 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4524  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.33 
 
 
193 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242648  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0111  phosphoesterase, PA-phosphatase related  41.76 
 
 
174 aa  52  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2901  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40 
 
 
224 aa  52  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0866647  normal  0.913295 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1172  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.82 
 
 
676 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.98006  normal  0.0665428 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1553  undecaprenyl-diphosphatase  45.98 
 
 
207 aa  52  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0983  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  36.63 
 
 
227 aa  52  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1131  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.89 
 
 
198 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1280  PAP2 family protein  32.98 
 
 
185 aa  51.2  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0275929  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0495  PAP2 superfamily protein  31.58 
 
 
195 aa  51.2  0.000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3422  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.75 
 
 
199 aa  50.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.631803  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1011  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.33 
 
 
217 aa  50.8  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.943443  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3076  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.75 
 
 
199 aa  50.8  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2918  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  37 
 
 
191 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547296  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2059  undecaprenyl-diphosphatase  38.46 
 
 
204 aa  50.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0523127  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2128  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.53 
 
 
199 aa  49.3  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.167938  normal  0.900368 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2672  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  29.21 
 
 
191 aa  49.3  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0110  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.03 
 
 
240 aa  49.7  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6467  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.16 
 
 
232 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.555163 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>