21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2935 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2935  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  159  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0981  hypothetical protein  65.57 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.644119  normal  0.810394 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3725  hypothetical protein  43.42 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2546  hypothetical protein  57.78 
 
 		 84 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.256304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2451  hypothetical protein  39.51 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459872  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1417  hypothetical protein  44.44 
 
 		 93 aa  50.4  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.267674  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2220  hypothetical protein  47.17 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.595512  normal  0.241423 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3243  hypothetical protein  34.18 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3185  hypothetical protein  61.29 
 
 		 101 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0152518  normal  0.782596 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4613  hypothetical protein  43.55 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.313817  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0455  hypothetical protein  62.5 
 
 		 227 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462018  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2012  hypothetical protein  59.38 
 
 		 240 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502792  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4254  hypothetical protein  48.84 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.319334  normal  0.900273 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4690  hypothetical protein  39.29 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2659  hypothetical protein  44.29 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1551  hypothetical protein  40.79 
 
 		 84 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2441  hypothetical protein  47.06 
 
 		 85 aa  44.3  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0176869 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0131  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0532893  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2482  hypothetical protein  47.73 
 
 		 103 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0500007  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0584  hypothetical protein  56.25 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18507  decreased coverage  0.00189585 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0602  hypothetical protein  50 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>