165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1692 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1692  transposase, IS4  100 
 
 		 135 aa  273  6e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.263222  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0014  transposase, IS4  99.15 
 
 		 241 aa  233  6e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0462942  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0246  transposase, IS4  99.15 
 
 		 241 aa  233  6e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.261546  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2500  transposase, IS4  99.15 
 
 		 241 aa  233  6e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0512  transposase, IS4  99.15 
 
 		 369 aa  232  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.692808  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0701  transposase, IS4  99.15 
 
 		 369 aa  232  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1095  transposase, IS4  99.15 
 
 		 369 aa  232  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1135  transposase, IS4  99.15 
 
 		 369 aa  232  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.064838  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1473  transposase, IS4  99.15 
 
 		 369 aa  232  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282239  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1498  transposase, IS4  99.15 
 
 		 369 aa  232  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1653  transposase, IS4  99.15 
 
 		 369 aa  232  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.891331  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1821  transposase, IS4  99.15 
 
 		 369 aa  232  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2160  transposase, IS4  99.15 
 
 		 369 aa  232  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.591575  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2596  transposase, IS4  99.15 
 
 		 369 aa  232  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3113  transposase, IS4  99.15 
 
 		 369 aa  232  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3140  transposase, IS4  99.15 
 
 		 369 aa  232  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3290  transposase, IS4  99.15 
 
 		 369 aa  232  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3391  transposase, IS4  99.15 
 
 		 369 aa  232  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.401653  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3414  transposase, IS4  99.15 
 
 		 369 aa  232  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3440  transposase, IS4  99.15 
 
 		 369 aa  232  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0308754  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3552  transposase, IS4  99.15 
 
 		 369 aa  232  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3654  transposase, IS4  99.15 
 
 		 369 aa  232  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.258841  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6919  transposase  87.72 
 
 		 369 aa  202  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.439237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7153  transposase  87.72 
 
 		 369 aa  202  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3911  transposase  87.72 
 
 		 369 aa  202  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.664589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2105  transposase, IS4  56.64 
 
 		 366 aa  122  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2168  transposase, IS4  56.64 
 
 		 366 aa  122  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.238923  normal  0.543726 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5660  transposase IS4 family protein  51.75 
 
 		 365 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.633118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1433  transposase, IS4 family protein  48.44 
 
 		 405 aa  110  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0283  transposase IS4  50.44 
 
 		 358 aa  108  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1069  transposase IS4  50.44 
 
 		 358 aa  108  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0456377 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2091  transposase IS4  50.44 
 
 		 358 aa  108  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000396436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2240  transposase IS4  50.44 
 
 		 358 aa  108  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000126004 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2488  transposase IS4  50.44 
 
 		 358 aa  108  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2883  transposase IS4  50.44 
 
 		 358 aa  108  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00446649 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0559  ISGsu2, transposase  47.71 
 
 		 361 aa  106  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360108  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1297  ISGsu2, transposase  47.71 
 
 		 361 aa  106  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274953  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2597  ISGsu2, transposase  47.71 
 
 		 361 aa  106  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0050  ISMca1, transposase  50 
 
 		 366 aa  105  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0096  ISMca1, transposase  50 
 
 		 366 aa  105  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0227  ISMca1, transposase  50 
 
 		 366 aa  105  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0751226  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0307  ISMca1, transposase  50 
 
 		 366 aa  105  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0723  ISMca1, transposase  50 
 
 		 366 aa  105  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.619399  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0980  ISMca1, transposase  50 
 
 		 366 aa  105  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1090  ISMca1, transposase  50 
 
 		 366 aa  105  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1177  ISMca1, transposase  50 
 
 		 366 aa  105  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1197  ISMca1, transposase  50 
 
 		 366 aa  105  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1312  ISMca1, transposase  50 
 
 		 366 aa  105  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1514  ISMca1, transposase  50 
 
 		 366 aa  105  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.332926  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1517  ISMca1, transposase  50 
 
 		 366 aa  105  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1580  ISMca1, transposase  50 
 
 		 366 aa  105  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1956  ISMca1, transposase  50 
 
 		 366 aa  105  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725664  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2178  ISMca1, transposase  50 
 
 		 366 aa  105  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2511  ISMca1, transposase  50 
 
 		 366 aa  105  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.229212  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2556  ISMca1, transposase  50 
 
 		 366 aa  105  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.186429  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2687  prophage LambdaMc01, ISMca1, transposase  50 
 
 		 366 aa  105  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.765288  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2810  ISMca1, transposase  50 
 
 		 366 aa  105  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2964  ISMca1, transposase  50 
 
 		 366 aa  105  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.223724  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0419  transposase, IS4 family protein  49.15 
 
 		 364 aa  105  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0155  transposase IS4 family protein  47.71 
 
 		 360 aa  102  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.193829  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0006  transposase IS4 family protein  47.71 
 
 		 360 aa  102  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0839  transposase IS4 family protein  47.71 
 
 		 360 aa  102  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000787198  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2311  transposase IS4 family protein  47.71 
 
 		 360 aa  102  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000514015  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1681  transposase IS4 family protein  47.71 
 
 		 360 aa  102  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0330564  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0440  transposase IS4 family protein  47.71 
 
 		 360 aa  102  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2694  transposase IS4 family protein  47.71 
 
 		 360 aa  102  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00558684  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3116  transposase IS4 family protein  47.71 
 
 		 360 aa  102  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000441936  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2513  transposase IS4 family protein  47.71 
 
 		 360 aa  102  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000127835  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1266  transposase, IS4  58.43 
 
 		 340 aa  102  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3706  transposase, IS4 family protein  42.86 
 
 		 354 aa  101  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6134  transposase IS4 family protein  50 
 
 		 368 aa  99.4  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.647313  normal  0.885579 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4959  transposase IS4 family protein  50 
 
 		 368 aa  99.4  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.428493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1337  transposase IS4 family protein  46.23 
 
 		 362 aa  98.6  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0686  transposase IS4 family protein  46.23 
 
 		 362 aa  98.6  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.278758  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1431  transposase, IS4 family protein  46.23 
 
 		 362 aa  98.6  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.771105 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1230  transposase, IS4 family protein  46.23 
 
 		 362 aa  98.6  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0806  transposase, IS4 family protein  46.23 
 
 		 362 aa  98.6  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1916  transposase, IS4 family protein  46.23 
 
 		 362 aa  98.6  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.176419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2866  transposase, IS4 family protein  46.23 
 
 		 362 aa  98.6  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.953499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2685  transposase, IS4 family protein  46.23 
 
 		 362 aa  98.6  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.235088  normal  0.541519 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2122  transposase, IS4 family protein  46.23 
 
 		 362 aa  98.6  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.973511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2015  transposase IS4 family protein  46.23 
 
 		 362 aa  98.6  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1871  transposase, IS4 family protein  46.23 
 
 		 362 aa  98.6  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.85058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3613  transposase, IS4 family protein  46.23 
 
 		 362 aa  98.6  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0222  transposase IS4 family protein  46.23 
 
 		 362 aa  98.6  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3410  transposase, IS4 family protein  46.23 
 
 		 362 aa  98.6  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3331  transposase, IS4 family protein  46.23 
 
 		 362 aa  98.6  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.343471  normal  0.0435671 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3918  transposase, IS4 family protein  46.23 
 
 		 362 aa  98.6  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3703  transposase, IS4 family protein  46.23 
 
 		 362 aa  98.6  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.757011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3184  transposase, IS4 family protein  46.23 
 
 		 362 aa  98.6  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1519  transposase, IS4 family protein  46.23 
 
 		 362 aa  98.6  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0754  transposase, IS4 family protein  46.23 
 
 		 362 aa  98.6  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0576  transposase, IS4 family protein  46.23 
 
 		 362 aa  98.6  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.78227  normal  0.0868679 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0089  transposase, IS4 family protein  46.23 
 
 		 362 aa  98.6  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2770  transposase, IS4  50 
 
 		 367 aa  97.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3984  transposase, IS4  50 
 
 		 367 aa  97.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0987  transposase, IS4  50 
 
 		 367 aa  97.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3687  transposase, IS4  50 
 
 		 367 aa  97.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3098  transposase, IS4  50 
 
 		 367 aa  97.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2726  transposase, IS4  50 
 
 		 367 aa  97.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0495453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>