56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1380 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3113  transposase, IS4  100 
 
 		 1110 bp  737    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2160  transposase, IS4  100 
 
 		 1110 bp  737    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.591575  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1821  transposase, IS4  100 
 
 		 1110 bp  737    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1692  transposase, IS4  95.09 
 
 		 408 bp  712    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.263222  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1653  transposase, IS4  100 
 
 		 1110 bp  737    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.891331  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1498  transposase, IS4  100 
 
 		 1110 bp  737    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1473  transposase, IS4  100 
 
 		 1110 bp  737    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282239  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1380    100 
 
 		 428 bp  848    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1135  transposase, IS4  100 
 
 		 1110 bp  737    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.064838  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1095  transposase, IS4  100 
 
 		 1110 bp  737    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0701  transposase, IS4  100 
 
 		 1110 bp  737    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0512  transposase, IS4  100 
 
 		 1110 bp  737    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.692808  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0246  transposase, IS4  100 
 
 		 726 bp  737    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.261546  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0014  transposase, IS4  100 
 
 		 726 bp  737    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0462942  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2500  transposase, IS4  100 
 
 		 726 bp  737    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2596  transposase, IS4  100 
 
 		 1110 bp  737    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3290  transposase, IS4  100 
 
 		 1110 bp  737    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3391  transposase, IS4  100 
 
 		 1110 bp  737    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.401653  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3414  transposase, IS4  100 
 
 		 1110 bp  737    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3440  transposase, IS4  100 
 
 		 1110 bp  737    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0308754  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3552  transposase, IS4  100 
 
 		 1110 bp  737    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3654  transposase, IS4  100 
 
 		 1110 bp  737    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.258841  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3140  transposase, IS4  100 
 
 		 1110 bp  737    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7153  transposase  88.01 
 
 		 1110 bp  327  1e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6919  transposase  88.01 
 
 		 1110 bp  327  1e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.439237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3911  transposase  88.01 
 
 		 1110 bp  327  1e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.664589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1814    87.7 
 
 		 456 bp  319  4e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.628479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2609  hypothetical protein  93.62 
 
 		 621 bp  69.9  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.763724  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5975    86.96 
 
 		 895 bp  65.9  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.100438  normal  0.316362 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1690  ISGsu2, transposase  100 
 
 		 804 bp  60  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0288166  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1039  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  96.43 
 
 		 966 bp  48.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0050  ISMca1, transposase  91.67 
 
 		 1101 bp  48.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1433  transposase, IS4 family protein  96.43 
 
 		 1218 bp  48.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3063  hypothetical protein  96.43 
 
 		 354 bp  48.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.767266 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5660  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 1098 bp  48.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.633118  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2810  ISMca1, transposase  91.67 
 
 		 1101 bp  48.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0096  ISMca1, transposase  91.67 
 
 		 1101 bp  48.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0227  ISMca1, transposase  91.67 
 
 		 1101 bp  48.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0751226  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0307  ISMca1, transposase  91.67 
 
 		 1101 bp  48.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0723  ISMca1, transposase  91.67 
 
 		 1101 bp  48.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.619399  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0980  ISMca1, transposase  91.67 
 
 		 1101 bp  48.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1090  ISMca1, transposase  91.67 
 
 		 1101 bp  48.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1177  ISMca1, transposase  91.67 
 
 		 1101 bp  48.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1197  ISMca1, transposase  91.67 
 
 		 1101 bp  48.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1312  ISMca1, transposase  91.67 
 
 		 1101 bp  48.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1514  ISMca1, transposase  91.67 
 
 		 1101 bp  48.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.332926  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1517  ISMca1, transposase  91.67 
 
 		 1101 bp  48.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1580  ISMca1, transposase  91.67 
 
 		 1101 bp  48.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1956  ISMca1, transposase  91.67 
 
 		 1101 bp  48.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725664  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2178  ISMca1, transposase  91.67 
 
 		 1101 bp  48.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2511  ISMca1, transposase  91.67 
 
 		 1101 bp  48.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.229212  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2556  ISMca1, transposase  91.67 
 
 		 1101 bp  48.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.186429  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2687  prophage LambdaMc01, ISMca1, transposase  91.67 
 
 		 1101 bp  48.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.765288  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2964  ISMca1, transposase  91.67 
 
 		 1101 bp  48.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.223724  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2291    91.43 
 
 		 478 bp  46.1  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4713    93.55 
 
 		 1102 bp  46.1  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0412243  normal  0.806779 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>