More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1379 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_0110  transposase, mutator type  99.12 
 
 
407 aa  651    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335509  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1379  transposase, mutator type  100 
 
 
366 aa  743    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2796  transposase, mutator type  96.45 
 
 
366 aa  672    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.520079  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3015  transposase, mutator type  99.12 
 
 
407 aa  651    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5112  transposase, mutator type  90.94 
 
 
407 aa  626  1e-178  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.540626  normal  0.120028 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5439  transposase mutator type  79.21 
 
 
406 aa  560  1e-158  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8282  transposase for insertion sequence element isrm3  76.32 
 
 
406 aa  553  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3615  transposase, mutator type  78.09 
 
 
407 aa  541  1e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3247  transposase, mutator type  77.81 
 
 
407 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.203349  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0805  transposase, mutator type  77.25 
 
 
407 aa  535  1e-151  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0776  transposase, mutator type  76.97 
 
 
407 aa  533  1e-150  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0287  transposase, mutator type  77.25 
 
 
407 aa  533  1e-150  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.286188  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3212  transposase, mutator type  77.53 
 
 
407 aa  530  1e-149  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.49013  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3613  transposase, mutator type  78.7 
 
 
375 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.230884  normal  0.701856 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3387  transposase, mutator type  76.4 
 
 
407 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2433  transposase mutator type  69.27 
 
 
408 aa  500  1e-140  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.226553  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6034  transposase mutator type  68.34 
 
 
400 aa  480  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0363265  normal  0.408755 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0271  transposase mutator family protein  60.56 
 
 
422 aa  442  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1082  transposase mutator family protein  60.85 
 
 
422 aa  444  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0319318  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2892  transposase mutator family protein  60.56 
 
 
422 aa  442  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3138  transposase mutator family protein  60.85 
 
 
422 aa  444  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.66274  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1528  transposase mutator family protein  60.56 
 
 
422 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.163505  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2348  transposase mutator family protein  60.28 
 
 
422 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3244  transposase mutator family protein  60.28 
 
 
422 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.625679  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5562  transposase, mutator type  61.82 
 
 
419 aa  431  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0358  transposase mutator family protein  62.11 
 
 
419 aa  432  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0431  transposase mutator family protein  62.11 
 
 
419 aa  432  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.72525  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0926  transposase mutator family protein  62.11 
 
 
419 aa  432  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1103  transposase mutator family protein  62.11 
 
 
419 aa  432  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.109528  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2748  transposase mutator family protein  62.11 
 
 
419 aa  432  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505573  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3131  transposase mutator family protein  62.11 
 
 
419 aa  432  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3772  transposase mutator type  61.82 
 
 
419 aa  431  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0597281 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0398  transposase, mutator type  61.82 
 
 
419 aa  431  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1201  transposase, mutator type  61.82 
 
 
419 aa  431  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1204  transposase, mutator type  61.82 
 
 
419 aa  431  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5297  transposase, mutator type  61.82 
 
 
419 aa  431  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1683  transposase, mutator type  61.82 
 
 
419 aa  431  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0027  ISMca5, transposase  57.42 
 
 
411 aa  429  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0677305  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1219  ISMca5, transposase  57.42 
 
 
411 aa  429  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0428861  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2936  transposase mutator type  61.82 
 
 
419 aa  429  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3315  transposase mutator type  56.39 
 
 
415 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4807  transposase mutator type  61.54 
 
 
419 aa  429  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.370083  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4726  transposase mutator type  61.54 
 
 
419 aa  430  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.685507  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5742  transposase mutator type  61.82 
 
 
419 aa  431  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.807876 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1787  transposase mutator type  62.11 
 
 
419 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.452427 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1793  transposase mutator type  62.11 
 
 
419 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.217248 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4789  transposase mutator type  61.82 
 
 
419 aa  431  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0356  transposase mutator type  61.54 
 
 
419 aa  427  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3187  transposase mutator type  56.23 
 
 
426 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2914  transposase mutator type  55.77 
 
 
415 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4451  transposase mutator type  57.14 
 
 
416 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0909  transposase mutator type  60.97 
 
 
419 aa  422  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.042433 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6124  transposase mutator type  56.23 
 
 
426 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6788  transposase mutator type  56.23 
 
 
426 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.1599  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0480  transposase, mutator type  57.42 
 
 
416 aa  422  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.690571  normal  0.698094 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1262  transposase, mutator type  57.42 
 
 
416 aa  422  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050865  normal  0.0250992 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1503  transposase, mutator type  57.42 
 
 
416 aa  422  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00430758  normal  0.0104636 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2268  transposase, mutator type  57.42 
 
 
416 aa  422  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.1465  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1179  transposase, mutator type  57.7 
 
 
416 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3752  transposase, mutator type  57.7 
 
 
416 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.223248 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0292  putative transposase, mutator type  56.06 
 
 
418 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0700  transposase, mutator type  57.7 
 
 
416 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.531735  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4611  transposase, mutator type  57.7 
 
 
416 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0252  ISRSO7-transposase protein  56.86 
 
 
416 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123171  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0478  ISRSO7-transposase protein  56.86 
 
 
416 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0158  transposase  55.25 
 
 
419 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.590957  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0568  transposase  55.25 
 
 
419 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0638  transposase  55.25 
 
 
419 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2200  transposase  55.25 
 
 
419 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1574  transposase mutator type  55.4 
 
 
425 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0782  transposase mutator type  55.4 
 
 
425 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622618  normal  0.382155 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1812  transposase mutator type  55.18 
 
 
416 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.39638 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5785  transposase mutator type  55.18 
 
 
416 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3417  transposase mutator type  55.12 
 
 
425 aa  411  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257312  normal  0.128425 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3172  transposase mutator type  56.58 
 
 
416 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0007  transposase mutator type  56.58 
 
 
416 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1272  transposase mutator type  56.58 
 
 
416 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.437771 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0255  transposase mutator type  56.58 
 
 
416 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.531318 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0720  transposase mutator type  56.58 
 
 
416 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216231  normal  0.208766 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0089  transposase mutator type  56.58 
 
 
416 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0149  transposase InsF  57.14 
 
 
411 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3142  transposase mutator type  56.58 
 
 
416 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.394881  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0505  transposase  57.7 
 
 
639 aa  410  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.804069  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2859  transposase mutator type  54.85 
 
 
425 aa  408  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622618  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2305  transposase mutator type  55.1 
 
 
425 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.505688 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4528  transposase mutator family protein  56.02 
 
 
416 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407435  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3165  transposase mutator type  55.49 
 
 
408 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3782  transposase, mutator type  55.49 
 
 
408 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1107  transposase, mutator type  55.49 
 
 
408 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.931145  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3336  transposase mutator type  55.49 
 
 
408 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2663  transposase, mutator type  55.49 
 
 
408 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.279268 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3917  transposase, mutator type  53.37 
 
 
404 aa  395  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3099  transposase, mutator type  53.37 
 
 
404 aa  395  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2555  transposase, mutator type  53.37 
 
 
404 aa  395  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.176663  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2884  transposase, mutator type  53.37 
 
 
404 aa  396  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4081  transposase, mutator type  53.37 
 
 
404 aa  395  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3703  transposase, mutator type  53.37 
 
 
404 aa  395  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3665  transposase, mutator type  53.37 
 
 
404 aa  395  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3704  transposase, mutator type  53.37 
 
 
404 aa  396  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0914  transposase, mutator type  55.21 
 
 
408 aa  396  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251188  normal  0.127076 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>