40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0801 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_0814  phage uncharacterized protein  69.16 
 
 
451 aa  640    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.93566  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0801  Phage uncharacterized protein-like  100 
 
 
466 aa  963    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.814229  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1184  Phage uncharacterized protein-like  43.41 
 
 
493 aa  376  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0804  phage uncharacterized protein  41.65 
 
 
485 aa  350  4e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0967  phage uncharacterized protein  37.89 
 
 
465 aa  349  6e-95  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.451476  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0377  Phage uncharacterized protein, C-terminal  38.24 
 
 
469 aa  344  2e-93  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0430074  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0665  phage uncharacterized protein  36.62 
 
 
469 aa  332  7.000000000000001e-90  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.410967  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1016  phage uncharacterized protein  38.19 
 
 
487 aa  330  3e-89  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0660227  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3556  phage uncharacterized protein  32.37 
 
 
490 aa  206  8e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0302  chaperone and heat shock protein 70  34.13 
 
 
484 aa  196  6e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.763978  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6997  phage uncharacterized protein  30.65 
 
 
491 aa  196  7e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3004  Phage uncharacterized protein-like  30.6 
 
 
484 aa  195  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6558  phage uncharacterized protein  31.97 
 
 
494 aa  193  7e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0181003  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00823  phage uncharacterized protein  31.99 
 
 
913 aa  179  7e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5956  phage uncharacterized protein  31.33 
 
 
456 aa  176  7e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.114161  normal  0.0123873 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2266  phage uncharacterized protein  30.34 
 
 
512 aa  171  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.830679  hitchhiker  0.000265113 
 
 
-
 
NC_002978  WD1132  phage uncharacterized protein  36.04 
 
 
295 aa  169  9e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1212  phage uncharacterized protein  31.65 
 
 
461 aa  168  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0224  phage uncharacterized protein  29.63 
 
 
488 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6256  hypothetical protein  29.83 
 
 
492 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2507  phage uncharacterized protein  32.71 
 
 
461 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2388  Phage uncharacterized protein, C-terminal  29.42 
 
 
516 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1048  phage uncharacterized protein  29.46 
 
 
516 aa  139  1e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0343018  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1307  hypothetical protein  29.27 
 
 
505 aa  137  6.0000000000000005e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2841  phage uncharacterized protein  26.97 
 
 
522 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3888  hypothetical protein  27.46 
 
 
496 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0542  phage uncharacterized protein  28.06 
 
 
495 aa  118  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0957  hypothetical protein  26.37 
 
 
469 aa  99.8  9e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000035245 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2225  phage uncharacterized protein  26.77 
 
 
547 aa  84.7  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0340068  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2971  phage uncharacterized protein  22.46 
 
 
471 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000566007  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1133  Phage terminase, large subunit  25.29 
 
 
462 aa  75.1  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.151722  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1778  hypothetical protein  25.06 
 
 
462 aa  72.4  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.187909  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2556  Phage uncharacterized protein-like  29.19 
 
 
505 aa  67.4  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2305  phage uncharacterized protein, putative  27.27 
 
 
491 aa  60.5  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0014  hypothetical protein  22.36 
 
 
484 aa  57.4  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0639  hypothetical protein  25 
 
 
519 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0679794  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2432  phage uncharacterized protein  29.1 
 
 
462 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.694395  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1106  phage uncharacterized protein-like protein  25.89 
 
 
601 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.139903 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0249  phage uncharacterized protein  20.71 
 
 
527 aa  50.1  0.00009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0755  hypothetical protein  24.21 
 
 
546 aa  44.3  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.891172  normal  0.995828 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>