37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3893 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3893  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
337 aa  666    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5102  GCN5-related N-acetyltransferase  38.31 
 
 
332 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0705936  normal  0.638402 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2992  GCN5-related N-acetyltransferase  36.99 
 
 
363 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.723176  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0184  GCN5-related N-acetyltransferase  37.08 
 
 
358 aa  142  7e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.741033  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11760  acetyltransferase (GNAT) family protein  36.55 
 
 
387 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0959824  normal  0.473581 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3785  GCN5-related protein N-acetyltransferase  36.9 
 
 
368 aa  139  4.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0643958  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2704  GCN5-related N-acetyltransferase  35.39 
 
 
380 aa  135  9e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0327579 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2703  GCN5-related N-acetyltransferase  35.14 
 
 
376 aa  132  7.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0753229 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2991  GCN5-related N-acetyltransferase  32.31 
 
 
374 aa  129  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0668932  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17530  hypothetical protein  35.42 
 
 
389 aa  127  3e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.373422  normal  0.317256 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35570  acetyltransferase (GNAT) family protein  34.14 
 
 
373 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0150  GCN5-related N-acetyltransferase  37.22 
 
 
378 aa  125  7e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0136832 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6108  GCN5-related N-acetyltransferase  33.45 
 
 
337 aa  112  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.427678  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0222  GCN5-related N-acetyltransferase  33.22 
 
 
367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6107  GCN5-related N-acetyltransferase  31.69 
 
 
341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6111  GCN5-related N-acetyltransferase  35.27 
 
 
337 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.634814  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5134  GCN5-related N-acetyltransferase  35.48 
 
 
337 aa  103  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6109  GCN5-related N-acetyltransferase  32.01 
 
 
339 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173643  normal  0.968842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0264  GCN5-related N-acetyltransferase  34.31 
 
 
338 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000116384 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20740  acetyltransferase (GNAT) family protein  33.33 
 
 
356 aa  100  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6110  GCN5-related N-acetyltransferase  33.21 
 
 
338 aa  98.6  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0914793  normal  0.97459 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  35.51 
 
 
332 aa  99  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.736196  hitchhiker  0.00168888 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0325  hypothetical protein  34.17 
 
 
360 aa  95.9  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0137923 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2503  GCN5-related N-acetyltransferase  33.04 
 
 
334 aa  95.1  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00168273  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0431  GCN5-related N-acetyltransferase  32.76 
 
 
337 aa  92.4  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546809  hitchhiker  0.00211796 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0361  GCN5-related N-acetyltransferase  32.84 
 
 
333 aa  91.3  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3532  GCN5-related N-acetyltransferase  31.32 
 
 
336 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6223  GCN5-related N-acetyltransferase  30.6 
 
 
332 aa  83.2  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06170  hypothetical protein  31.64 
 
 
346 aa  82  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0723  GCN5-related N-acetyltransferase  31.08 
 
 
340 aa  76.6  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00134722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2083  GCN5-related N-acetyltransferase  30.08 
 
 
369 aa  73.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.45347  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8300  GCN5-related N-acetyltransferase  35.81 
 
 
339 aa  63.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.482845 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2313  GCN5-related N-acetyltransferase  33.75 
 
 
334 aa  62.4  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33440  acetyltransferase (GNAT) family protein  31.3 
 
 
331 aa  62.4  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.100761 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7043  hypothetical protein  29.75 
 
 
325 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4645  acetyltransferase  30.14 
 
 
338 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.158798  normal  0.426829 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0047  GCN5-related N-acetyltransferase  31.62 
 
 
339 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.163048  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>