52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3523 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3523  hypothetical protein  100 
 
 		 375 aa  719    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2792  hypothetical protein  62.53 
 
 		 362 aa  436  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0226993  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2452  hypothetical protein  51.36 
 
 		 384 aa  322  6e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000678716  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4070  hypothetical protein  49.18 
 
 		 365 aa  300  4e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0178352  normal  0.419833 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5370  hypothetical protein  49.46 
 
 		 371 aa  287  2e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.861425 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4984  hypothetical protein  46.22 
 
 		 373 aa  278  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5325  hypothetical protein  47.62 
 
 		 365 aa  258  1e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4736  hypothetical protein  47.22 
 
 		 366 aa  255  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.968842 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3510  hypothetical protein  47.59 
 
 		 404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0541422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3488  hypothetical protein  45.87 
 
 		 355 aa  241  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6205  hypothetical protein  40.81 
 
 		 372 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.454836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5246  hypothetical protein  44.8 
 
 		 366 aa  239  5.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422141 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5461  hypothetical protein  40.65 
 
 		 367 aa  237  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7635  hypothetical protein  43.56 
 
 		 363 aa  237  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.678328 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3370  hypothetical protein  43.85 
 
 		 368 aa  236  7e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.357323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0975  hypothetical protein  43.63 
 
 		 377 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4150  hypothetical protein  42.7 
 
 		 374 aa  222  9e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4303  hypothetical protein  43.84 
 
 		 374 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4281  hypothetical protein  43.29 
 
 		 374 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.355185  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3484  hypothetical protein  35.7 
 
 		 422 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0164  hypothetical protein  37.82 
 
 		 355 aa  184  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2728  hypothetical protein  35.77 
 
 		 367 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.683635  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2067  hypothetical protein  38.61 
 
 		 379 aa  142  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0357547 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0019  hypothetical protein  33.73 
 
 		 389 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0286  hypothetical protein  38.56 
 
 		 375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3435  protein of unknown function DUF1006  32.41 
 
 		 382 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1894  hypothetical protein  33.24 
 
 		 367 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1792  hypothetical protein  27.25 
 
 		 377 aa  90.1  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0878  hypothetical protein  22.42 
 
 		 357 aa  73.9  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6445  hypothetical protein  27.4 
 
 		 412 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0946516  normal  0.0409741 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3338  hypothetical protein  28.16 
 
 		 395 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2734  hypothetical protein  27.87 
 
 		 378 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00345786 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3022  hypothetical protein  25.45 
 
 		 395 aa  57  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628375  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1330  hypothetical protein  31.85 
 
 		 353 aa  55.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0139  hypothetical protein  29.05 
 
 		 393 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4328  hypothetical protein  29.75 
 
 		 353 aa  55.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0822537 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0441  hypothetical protein  30.3 
 
 		 373 aa  52.8  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.22704 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3001  hypothetical protein  27.21 
 
 		 355 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0393285  normal  0.0371418 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3996  hypothetical protein  30.04 
 
 		 397 aa  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880784  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2094  hypothetical protein  28.31 
 
 		 370 aa  51.6  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0155004  normal  0.0950605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5001  hypothetical protein  23.06 
 
 		 352 aa  50.8  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0712295  normal  0.0100104 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3547  hypothetical protein  30.77 
 
 		 412 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.412698 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3211  hypothetical protein  31.9 
 
 		 368 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474284  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5273  hypothetical protein  22.69 
 
 		 357 aa  47.4  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2788  hypothetical protein  28.99 
 
 		 369 aa  47  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0821  hypothetical protein  25.32 
 
 		 391 aa  46.6  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.452627  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6013  hypothetical protein  27.62 
 
 		 342 aa  46.6  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.994195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0283  hypothetical protein  18.64 
 
 		 367 aa  46.2  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3030  hypothetical protein  26.87 
 
 		 355 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2986  hypothetical protein  26.87 
 
 		 355 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.223704  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0405  hypothetical protein  25.62 
 
 		 394 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.272447 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1325  hypothetical protein  24.66 
 
 		 383 aa  44.7  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.397251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>