22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0618 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0618  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
670 aa  1318    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.958983  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1641  hypothetical protein  44.54 
 
 
640 aa  437  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0634  hypothetical protein  46.26 
 
 
513 aa  270  8.999999999999999e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.135526 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0881  family 2 glycosyl transferase  48.41 
 
 
369 aa  263  6e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1644  hypothetical protein  47.52 
 
 
373 aa  263  8e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.946306 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4580  hypothetical protein  45.56 
 
 
429 aa  233  7.000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4584  glycosyl transferase family protein  41.63 
 
 
546 aa  213  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26800  glycosyl transferase  36.47 
 
 
617 aa  127  7e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.955203 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0159  family 2 glycosyl transferase  31.85 
 
 
694 aa  120  7.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26830  hypothetical protein  32.03 
 
 
629 aa  115  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27770  hypothetical protein  31.25 
 
 
641 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0373  hypothetical protein  30.84 
 
 
685 aa  105  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0624  glycosyltransferase  28.37 
 
 
249 aa  83.6  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1469  glycosyl transferase family 2  27.76 
 
 
267 aa  79  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1635  hypothetical protein  30.1 
 
 
650 aa  70.9  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168505  normal  0.43752 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4970  bifunctional hypothetical protein/glycosyltransferase  23.53 
 
 
1176 aa  57.8  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2561  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.13 
 
 
957 aa  56.2  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0876  hypothetical protein  29.44 
 
 
671 aa  55.5  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.912844  normal  0.438141 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5052  glycosyl transferase family 2  29.33 
 
 
897 aa  45.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00429729  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4105  glycosyl transferase family 2  32.56 
 
 
317 aa  44.7  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.852576  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5173  glycosyl transferase family 2  29.25 
 
 
330 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.65386  normal  0.331666 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
1250 aa  43.9  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>