29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3823 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3823  pentapeptide repeat protein  100 
 
 		 254 aa  510  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.199719  normal  0.0347073 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1041  pentapeptide repeat-containing protein  64.05 
 
 		 265 aa  309  2.9999999999999997e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2076  pentapeptide repeat-containing protein  61 
 
 		 266 aa  293  2e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0171382  normal  0.301394 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2675  pentapeptide repeat-containing protein  45.7 
 
 		 250 aa  192  4e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.33412  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3732  pentapeptide repeat-containing protein  47.58 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.612833  normal  0.0137169 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0945  pentapeptide repeat protein  44.27 
 
 		 264 aa  179  4.999999999999999e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5585  pentapeptide repeat protein  44.31 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3680  pentapeptide repeat protein  41.15 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0611357  normal  0.412611 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4160  pentapeptide repeat-containing protein  40.56 
 
 		 266 aa  138  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  43.04 
 
 		 973 aa  49.7  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1107  TPR repeat-containing protein  48.89 
 
 		 266 aa  46.6  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.684682  normal  0.836 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0183  pentapeptide repeat-containing protein  42 
 
 		 170 aa  46.2  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08151  hypothetical protein  42 
 
 		 170 aa  46.2  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  48.98 
 
 		 343 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  48.98 
 
 		 343 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  33.75 
 
 		 267 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3749  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.71 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  37.33 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0195  hypothetical protein  42.31 
 
 		 142 aa  43.9  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.673966 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  28.41 
 
 		 168 aa  43.5  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  31.25 
 
 		 1033 aa  43.9  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_002978  WD0440  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 		 601 aa  42.7  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.203481  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1884  pentapeptide repeat protein  34.21 
 
 		 106 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000561383 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  50 
 
 		 184 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  33.33 
 
 		 745 aa  42.7  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  37.74 
 
 		 401 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 844 aa  42.4  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  37.74 
 
 		 401 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  36.62 
 
 		 309 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>