12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3577 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3577  TniQ family protein  100 
 
 		 407 aa  819    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0706835  hitchhiker  0.00685617 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1175  transposition protein TniQ  42.46 
 
 		 405 aa  281  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.751536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3008  hypothetical protein  42.96 
 
 		 405 aa  281  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00754024 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4043  transposon related protein TniQ (Tn6048)  42.96 
 
 		 405 aa  281  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.705627  normal  0.297499 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4974  transposon related protein TniQ (Tn6048)  42.96 
 
 		 405 aa  281  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.39202  normal  0.593439 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3049  hypothetical protein  24.86 
 
 		 397 aa  48.9  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.356075 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1645  hypothetical protein  23.84 
 
 		 342 aa  46.2  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1578  hypothetical protein  29 
 
 		 356 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.223334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4234  hypothetical protein  26.06 
 
 		 348 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.877652 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1682  hypothetical protein  28.57 
 
 		 353 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2934  hypothetical protein  28.57 
 
 		 353 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.229686  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2522  hypothetical protein  29.7 
 
 		 357 aa  43.9  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.716097  normal  0.197177 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>