19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0146 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0146  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
337 aa  668    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3792  hypothetical protein  48.53 
 
 
335 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460925  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0835  hypothetical protein  39.34 
 
 
364 aa  179  8e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.788787  normal  0.0618655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8963  hypothetical protein  42.29 
 
 
318 aa  149  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0158  serine/threonine protein kinase  25.39 
 
 
557 aa  57  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3488  serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 
524 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.562336  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5575  Serine/threonine protein kinase  26.14 
 
 
333 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7552  hypothetical protein  32.58 
 
 
341 aa  46.6  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.253743  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0023  serine/threonine protein kinase  24.48 
 
 
746 aa  46.2  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3066  serine/threonine protein kinase  28.64 
 
 
1311 aa  45.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.454085  normal  0.0824446 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3601  serine-threonine kinase Stk1  26.43 
 
 
329 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0106  protein kinase  25.11 
 
 
323 aa  45.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3539  protein kinase  29.63 
 
 
403 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0867944  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2255  serine/threonine protein kinase  29.55 
 
 
450 aa  44.3  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.670463  normal  0.103356 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5416  serine/threonine protein kinase, putative  25.76 
 
 
331 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  22.22 
 
 
627 aa  43.9  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0135  serine/threonine protein kinase  25 
 
 
562 aa  43.5  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.340026 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42880  serine-threonine kinase Stk1  25.96 
 
 
329 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.576441 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1077  serine/threonine protein kinase  29.6 
 
 
503 aa  43.1  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>