12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5502 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5502  hypothetical protein  100 
 
 
350 aa  699    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0540221 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1306  hypothetical protein  82.81 
 
 
370 aa  569  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5255  hypothetical protein  79.94 
 
 
376 aa  531  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435097  normal  0.69771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4887  hypothetical protein  79.94 
 
 
376 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0537517  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4976  hypothetical protein  79.94 
 
 
376 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13739  hypothetical protein  72.97 
 
 
336 aa  498  1e-140  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.101062  normal  0.216027 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2970  hypothetical protein  30.08 
 
 
370 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.751767  normal  0.167477 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0806  hypothetical protein  28.49 
 
 
410 aa  89.4  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.934082  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2125  hypothetical protein  27.93 
 
 
320 aa  86.7  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5522  hypothetical protein  29.94 
 
 
371 aa  85.9  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.853914 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2501  hypothetical protein  34.13 
 
 
371 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.942803  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2002  hypothetical protein  27.1 
 
 
502 aa  48.5  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>