53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5072 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5072  cyclase/dehydrase  100 
 
 
146 aa  300  6.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.257189  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1679  cyclase/dehydrase  86.3 
 
 
146 aa  271  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.846204  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4498  cyclase/dehydrase  65.73 
 
 
147 aa  189  9e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4585  cyclase/dehydrase  65.73 
 
 
147 aa  189  9e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4881  cyclase/dehydrase  65.03 
 
 
147 aa  188  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.142178 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10874  hypothetical protein  58.74 
 
 
157 aa  181  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0259226 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10873  hypothetical protein  59.54 
 
 
144 aa  168  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.034604 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5071  cyclase/dehydrase  54.11 
 
 
148 aa  161  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.954892  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1678  cyclase/dehydrase  48.94 
 
 
146 aa  143  8.000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613724  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5073  cyclase/dehydrase  46.48 
 
 
156 aa  143  9e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.053477  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4587  cyclase/dehydrase  47.89 
 
 
148 aa  137  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4883  cyclase/dehydrase  47.89 
 
 
148 aa  137  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0833406 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4500  cyclase/dehydrase  47.89 
 
 
148 aa  137  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0509  cyclase/dehydrase  45.77 
 
 
145 aa  131  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257831  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10871  hypothetical protein  43.66 
 
 
147 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0253989 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4586  cyclase/dehydrase  43.66 
 
 
146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.30543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4499  cyclase/dehydrase  43.66 
 
 
146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4882  cyclase/dehydrase  43.66 
 
 
146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4588  cyclase/dehydrase  44.37 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.464947 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4501  cyclase/dehydrase  44.37 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4884  cyclase/dehydrase  44.37 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0728  cyclase/dehydrase  36.17 
 
 
146 aa  104  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2812  cyclase/dehydrase  37.76 
 
 
149 aa  100  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0847205  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3095  cyclase/dehydrase  34.51 
 
 
144 aa  92  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24890  polyketide cyclase / dehydrase family protein  34.27 
 
 
147 aa  89.7  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.370837  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2678  Polyketide cyclase/dehydrase  35.21 
 
 
153 aa  89.7  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.368637  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1822  cyclase/dehydrase  33.8 
 
 
148 aa  89.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.292754 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2811  cyclase/dehydrase  35.42 
 
 
150 aa  88.6  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0739801  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3112  cyclase/dehydrase  34.51 
 
 
146 aa  87.4  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3329  cyclase/dehydrase  30.99 
 
 
144 aa  85.9  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3049  cyclase/dehydrase  31.69 
 
 
143 aa  84  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00119371  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1386  cyclase/dehydrase  32.62 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.339684  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3233  cyclase/dehydrase  34.93 
 
 
145 aa  82.4  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00925332  hitchhiker  0.0000878109 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1306  cyclase/dehydrase  36.55 
 
 
145 aa  81.3  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138672  normal  0.43501 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4867  cyclase/dehydrase  30.61 
 
 
152 aa  74.7  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0585071 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2698  hypothetical protein  33.1 
 
 
145 aa  73.6  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707169  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12213  hypothetical protein  30.77 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2964  cyclase/dehydrase  30.07 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3547  cyclase/dehydrase  30.34 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.464077 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3291  cyclase/dehydrase  30.28 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.16801 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3276  cyclase/dehydrase  28.47 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253678  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3044  cyclase/dehydrase  33.33 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3280  cyclase/dehydrase  30.34 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3342  cyclase/dehydrase  30.34 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.330453  normal  0.30543 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0938  cyclase/dehydrase  31.58 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.567828  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6066  cyclase/dehydrase  30.56 
 
 
146 aa  66.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3508  cyclase/dehydrase  29.05 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0113  hypothetical protein  27.01 
 
 
148 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0103  cyclase/dehydrase  27.01 
 
 
148 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.137668 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0122  cyclase/dehydrase  27.01 
 
 
148 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.367353  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0129  cyclase/dehydrase  25.55 
 
 
146 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.692417  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0716  cyclase/dehydrase  24.09 
 
 
146 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10165  hypothetical protein  25.55 
 
 
161 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>