20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3907 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3907  protein of unknown function DUF1236  100 
 
 		 144 aa  282  1.0000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1616  hypothetical protein  34.88 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.735089  hitchhiker  0.000199985 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0234  hypothetical protein  35.66 
 
 		 138 aa  67  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.301588  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0372  hypothetical protein  37.32 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5270  hypothetical protein  35.71 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.100526  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1184  hypothetical protein  30.07 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0429194 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5927  protein of unknown function DUF1236  34.27 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0154  protein of unknown function DUF1236  37.84 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.285962 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1342  protein of unknown function DUF1236  29.37 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4345  hypothetical protein  32.09 
 
 		 118 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0703177 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0136  hypothetical protein  36.81 
 
 		 139 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2358  hypothetical protein  36.23 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.318896  normal  0.1272 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3209  hypothetical protein  31.94 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.542631  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2585  hypothetical protein  31.94 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.100754 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2609  protein of unknown function DUF1236  35.77 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.330788  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2804  protein of unknown function DUF1236  34.96 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.581612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2581  hypothetical protein  34.96 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1431  hypothetical protein  31.97 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191025  hitchhiker  0.0000578227 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0569  protein of unknown function DUF1236  39.13 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0713  hypothetical protein  37.93 
 
 		 139 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>