35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1864 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1864  diphthamide biosynthesis protein  100 
 
 		 332 aa  682    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.866923 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1270  diphthamide biosynthesis protein  61.26 
 
 		 333 aa  448  1e-125  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1803  diphthamide biosynthesis protein  36.68 
 
 		 349 aa  172  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3588  diphthamide biosynthesis protein  35.38 
 
 		 353 aa  171  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0218  hypothetical protein  33.86 
 
 		 316 aa  168  1e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1436  diphthamide biosynthesis protein  32.72 
 
 		 331 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0813  diphthamide biosynthesis protein  32.83 
 
 		 347 aa  163  3e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.528127 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0882  diphthamide biosynthesis protein  34.07 
 
 		 340 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2799  diphthamide biosynthesis protein  32.51 
 
 		 349 aa  159  6e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.815597  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2492  diphthamide biosynthesis protein  32.12 
 
 		 348 aa  157  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1634  diphthamide synthase subunit  32 
 
 		 335 aa  154  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2168  diphthamide biosynthesis protein  32.7 
 
 		 317 aa  153  4e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.614157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1635  diphthamide biosynthesis protein  34.24 
 
 		 334 aa  151  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0484  diphthamide biosynthesis protein  33.12 
 
 		 325 aa  150  2e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2082  diphthamide biosynthesis protein  34.04 
 
 		 315 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.829732 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1846  diphthamide biosynthesis protein  33.44 
 
 		 315 aa  145  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0764  diphthamide biosynthesis protein  30.3 
 
 		 309 aa  137  4e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1187  diphthamide biosynthesis protein  30 
 
 		 309 aa  133  5e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.20081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2613  diphthamide biosynthesis protein  32.17 
 
 		 295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1488  diphthamide biosynthesis protein  29.7 
 
 		 309 aa  129  6e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1563  diphthamide biosynthesis protein  26.93 
 
 		 331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1190  diphthamide biosynthesis protein  29.41 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35812  predicted protein  29.06 
 
 		 421 aa  110  3e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0979008 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43090  predicted protein  28.66 
 
 		 452 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0109024  normal  0.0260674 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0905  diphthamide biosynthesis protein  24.7 
 
 		 331 aa  104  3e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20589  predicted protein  29.57 
 
 		 434 aa  96.3  6e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1133  diphthamide biosynthesis protein  26.51 
 
 		 337 aa  87.4  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.45882 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1360  hypothetical protein  23.92 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00886743 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07400  cytoplasm protein, putative  25.27 
 
 		 529 aa  56.6  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.185161  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0393  diphthamide biosynthesis protein  22.73 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0784701 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1114  diphthamide biosynthesis protein  21.24 
 
 		 302 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02230  peptidyl-diphthamide biosynthesis, putative  20.91 
 
 		 515 aa  44.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06283  Diphthamide biosynthesis protein 1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AZJ7]  23.81 
 
 		 193 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.558592  normal  0.316973 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83454  predicted protein  22.13 
 
 		 560 aa  44.3  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.171187 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32667  predicted protein  29.01 
 
 		 517 aa  42.7  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.563535  normal  0.65168 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>