12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0224 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0224  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  258  3e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.166196  decreased coverage  0.00859524 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1187  protein of unknown function DUF343  62.02 
 
 		 129 aa  164  2.9999999999999998e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1880  hypothetical protein  56.41 
 
 		 133 aa  139  9.999999999999999e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0346889  normal  0.0669854 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0227  hypothetical protein  49.64 
 
 		 140 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0863443 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2163  hypothetical protein  49.64 
 
 		 141 aa  128  3e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0815  hypothetical protein  50.81 
 
 		 123 aa  124  6e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2004  hypothetical protein  47.1 
 
 		 140 aa  118  3e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.462402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1047  hypothetical protein  46.38 
 
 		 140 aa  118  3e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.516502  normal  0.973248 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0246  hypothetical protein  34.92 
 
 		 89 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1284  hypothetical protein  33.67 
 
 		 60 aa  47.8  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0864  hypothetical protein  30.3 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3215  protein of unknown function DUF343  30.3 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>