39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1410 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1410  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  100 
 
 		 73 aa  150  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.251698  normal  0.111999 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1745  DNA binding domain protein, excisionase family  81.54 
 
 		 68 aa  120  5e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.453337 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1579  DNA binding domain protein, excisionase family  50.94 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.963252  normal  0.220961 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0025  DNA binding domain protein, excisionase family  46 
 
 		 63 aa  50.4  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.917253  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0403  DNA binding domain-containing protein  50 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00109148  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3699  hypothetical protein  38.46 
 
 		 55 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1200  excisionase/Xis, DNA-binding  42 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00000791415  normal  0.674457 
 
 
-
 
NC_002936  DET0882  excisionase family DNA-binding protein  40.82 
 
 		 74 aa  43.9  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000814624  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1985  DNA binding domain protein, excisionase family  34.92 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000030807  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2744  DNA binding domain protein, excisionase family  41.94 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.587836  hitchhiker  0.00613887 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0229  putative molybdopterin biosynthesis protein  38.3 
 
 		 306 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0085  DNA binding domain-containing protein  31.67 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0754203  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0991  DNA binding domain protein, excisionase family  39.62 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.153101  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5098  periplasmic molybdate-binding protein  38.3 
 
 		 306 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02760  DNA-binding protein, excisionase family  42.22 
 
 		 71 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0223  molybdopterin biosynthesis protein, putative  36.17 
 
 		 315 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5764  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  42.55 
 
 		 69 aa  41.2  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0194  molybdate-binding protein  36.17 
 
 		 315 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0246  putative molybdopterin biosynthesis protein  36.17 
 
 		 306 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0204  molybdopterin biosynthesis protein  36.17 
 
 		 306 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0222  putative molybdopterin biosynthesis protein  36.17 
 
 		 306 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0190  molybdate-binding protein  36.17 
 
 		 315 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3695  putative helicase  28.3 
 
 		 676 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.783104  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0205  molybdopterin biosynthesis protein  36.17 
 
 		 306 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0812  DNA binding domain protein, excisionase family  39.58 
 
 		 308 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1737  DNA binding domain protein, excisionase family  38.3 
 
 		 315 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0057  DNA binding domain protein, excisionase family  37.04 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3698  DNA binding domain protein, excisionase family  39.22 
 
 		 59 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0201  DNA binding domain-containing protein  36.17 
 
 		 305 aa  40.8  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5521  DNA binding domain-containing protein  46.51 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00471418  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5748  excision promoter, Xis  38.98 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0537  hypothetical protein  35.59 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8339  excision promoter, Xis  40.91 
 
 		 74 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0663  DNA binding domain-containing protein  40.38 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.292535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4450  DNA binding domain protein, excisionase family  35.59 
 
 		 67 aa  40.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0643  DNA binding domain protein, excisionase family  43.75 
 
 		 81 aa  40.4  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0251  excisionase family DNA binding domain-containing protein  35.59 
 
 		 67 aa  40.4  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3678  excision promoter, Xis  31.08 
 
 		 97 aa  40  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1847  hypothetical protein  31.48 
 
 		 74 aa  40  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.983219  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>