28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0891 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0915  hypothetical protein  87.94 
 
 
597 aa  985    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.342242  normal  0.94369 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0891  hypothetical protein  100 
 
 
597 aa  1161    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0952  hypothetical protein  87.94 
 
 
597 aa  983    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0111179 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2312  hypothetical protein  47.35 
 
 
599 aa  435  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2015  hypothetical protein  44.9 
 
 
587 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4186  hypothetical protein  47.97 
 
 
602 aa  395  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.286802  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7240  hypothetical protein  42.03 
 
 
588 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.510618  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1333  hypothetical protein  35.38 
 
 
587 aa  265  2e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.367771  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5545  hypothetical protein  41.67 
 
 
532 aa  205  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.352354 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1101  hypothetical protein  39.02 
 
 
501 aa  151  3e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.322758 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2544  hypothetical protein  37.46 
 
 
497 aa  149  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.337624 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1669  hypothetical protein  38.16 
 
 
535 aa  142  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.118231 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4453  hypothetical protein  35.34 
 
 
535 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.74365  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3815  hypothetical protein  36.4 
 
 
535 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.108699  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1487  hypothetical protein  36.2 
 
 
525 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.707292 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5535  hypothetical protein  38.54 
 
 
623 aa  104  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0408605 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6508  flagellar hook-associated protein FlgL  31.78 
 
 
344 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.632547  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0044  flagellar hook-associated protein FlgL  27.78 
 
 
347 aa  50.1  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4191  flagellar hook-associated protein FlgL  32.28 
 
 
348 aa  47.8  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.8937  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3479  flagellar hook-associated protein FlgL  29.01 
 
 
358 aa  47.8  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.927973  normal  0.0673338 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3377  flagellar hook-associated protein FlgL  29.38 
 
 
336 aa  47  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0692  flagellin, putative  31.29 
 
 
304 aa  46.6  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.914125 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3555  flagellar hook-associated protein FlgL  24.11 
 
 
348 aa  45.8  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5249  flagellar hook-associated protein FlgL  30.15 
 
 
348 aa  45.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.490883 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5529  flagellar hook-associated protein FlgL  29.03 
 
 
348 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0173454 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1137  flagellar hook-associated protein FlgL  28.67 
 
 
348 aa  45.1  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512733  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1042  flagellar hook-associated protein FlgL  28.67 
 
 
351 aa  45.1  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0659  flagellar hook-associated protein FlgL  30.58 
 
 
350 aa  43.5  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.404384 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>