21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_BR0019 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_BR0019  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.167902  normal  0.135206 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0055  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_BR0017  tRNA-Pro  88.46 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.11451  normal  0.135748 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0056  tRNA-Pro  88.24 
 
 		 74 bp  54  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000452415  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0016  tRNA-Pro  88.24 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0045  tRNA-Pro  88.24 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0041  tRNA-Pro  87.04 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.83752 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0018  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0028  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0018  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0036  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0012  tRNA-Pro  83.12 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.762181  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0011  tRNA-Pro  86.54 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0044  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.261582 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0020  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0219771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0071  tRNA-Pro  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000011229  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4313  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0076  tRNA-Pro  86.27 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000227874  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0021  tRNA-Pro  86.27 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.18962 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0014  tRNA-Pro  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0035  tRNA-Pro  86.96 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.877859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>